【建议】关于如何提蛋白质纯化问题(附例)
丁香园论坛
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在得不到足够信息的情况下,往往比较难以分析,大家多是在假定一些信息来回答问题,这样有时候碰巧符合了,但也有推断错误的时候。这样对解决问题是不利的。
如果不涉及到技术保密问题,关于蛋白质纯化问题都建议按下列信息来提问。
1、建议贴张SDS-PAGE图来分析一下,最好包括:
Marker,胶浓度,变性还是非变性
诱导前
诱导后
破菌上清
破菌沉淀
沉淀洗涤上清
变性溶解上清
变性溶解沉淀
柱纯化前
柱纯化穿透
柱洗脱
等各个样品。
标上marker大小,电泳条带说明,从左到右,或1234567.....
2、建议把流程中的各个部分所用缓冲液说明一下,例如:
破菌缓冲液:如pH8.0,20mMTris,0.5N NaCl
破菌方法:如超声,4s工作,4s间隙,冰水浴,共200次
包涵体洗涤液:如PBS(pH7.4,20mM PB,0.15N NaCl)
包涵体溶解液:如pH8.0,20mMTris,0.5N NaCl,8M尿素
柱平衡液:如pH8.0,20mMTris,0.5N NaCl,8M尿素,20mM 咪唑
柱淋洗液:如pH8.0,20mMTris,0.5N NaCl,8M尿素,40mM 咪唑
柱洗脱液:如pH8.0,20mMTris,0.5N NaCl,8M尿素,200mM 咪唑
柱洗脱方法:如分段洗脱,线性梯度洗脱等
3、建议说明纯化规模和纯化设备,例如:
一次纯化所用的菌体量:如10g湿菌体或500ml摇瓶发酵菌等
破菌缓冲液体积:如150ml
包涵体洗涤,溶解液体积:包涵体洗涤液每次150ml,共洗涤3次;包涵体用50ml包涵体溶解液溶解,搅拌过夜
纯化用柱类型:如XK26/20、或自制、或国产16/20、或预装柱等
纯化用柱大小:如40ml
柱淋洗液用量:如200ml
柱洗脱液用量:如150ml
纯化仪器:如国产、AKTA Explorer 100、Duoflow
4、建议适当说明目标蛋白的性质,例如:
载体类型:PET32a
Tag类型:融合硫氧还蛋白,histag6
理论分子量:如融合蛋白共35kd,目标蛋白17kd(不含硫氧还蛋白)
理论等电点:如融合蛋白pI7.0,目标蛋白pI8.5等
另外,建议大家先搜索本版,很多问题的答案早就有了!
想学习蛋白质纯化的战友,请看看本版的精华区,那儿可是个宝库。
如果不涉及到技术保密问题,关于蛋白质纯化问题都建议按下列信息来提问。
1、建议贴张SDS-PAGE图来分析一下,最好包括:
Marker,胶浓度,变性还是非变性
诱导前
诱导后
破菌上清
破菌沉淀
沉淀洗涤上清
变性溶解上清
变性溶解沉淀
柱纯化前
柱纯化穿透
柱洗脱
等各个样品。
标上marker大小,电泳条带说明,从左到右,或1234567.....
2、建议把流程中的各个部分所用缓冲液说明一下,例如:
破菌缓冲液:如pH8.0,20mMTris,0.5N NaCl
破菌方法:如超声,4s工作,4s间隙,冰水浴,共200次
包涵体洗涤液:如PBS(pH7.4,20mM PB,0.15N NaCl)
包涵体溶解液:如pH8.0,20mMTris,0.5N NaCl,8M尿素
柱平衡液:如pH8.0,20mMTris,0.5N NaCl,8M尿素,20mM 咪唑
柱淋洗液:如pH8.0,20mMTris,0.5N NaCl,8M尿素,40mM 咪唑
柱洗脱液:如pH8.0,20mMTris,0.5N NaCl,8M尿素,200mM 咪唑
柱洗脱方法:如分段洗脱,线性梯度洗脱等
3、建议说明纯化规模和纯化设备,例如:
一次纯化所用的菌体量:如10g湿菌体或500ml摇瓶发酵菌等
破菌缓冲液体积:如150ml
包涵体洗涤,溶解液体积:包涵体洗涤液每次150ml,共洗涤3次;包涵体用50ml包涵体溶解液溶解,搅拌过夜
纯化用柱类型:如XK26/20、或自制、或国产16/20、或预装柱等
纯化用柱大小:如40ml
柱淋洗液用量:如200ml
柱洗脱液用量:如150ml
纯化仪器:如国产、AKTA Explorer 100、Duoflow
4、建议适当说明目标蛋白的性质,例如:
载体类型:PET32a
Tag类型:融合硫氧还蛋白,histag6
理论分子量:如融合蛋白共35kd,目标蛋白17kd(不含硫氧还蛋白)
理论等电点:如融合蛋白pI7.0,目标蛋白pI8.5等
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