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【交流】核酸版2005年8月份明星技术: allele-specific expression assay

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本期明星技术:allele-specific expression analysis/assay

人类基因组计划的结构基因组测序完成后,留下了海量的序列信息。然而,这些序列有何功能,多数尚不得而知。在序列功能研究中,除了基因及其亚结构功能探讨外,还有一个重要的内容,那就是同一序列的多型性也可能具有不同的功能(或具有不同的功能强度)。特别是近来的研究已经肯定性地证明,很多位点同一位置因碱基不同而所致的多态或突变(如SNPs),在功能上呈现很大的差异。以前探讨多态或突变的潜在功能,多从表型分析入手,这种黑箱式的分析无法阐明具体的分子作用机制。allele-specific expression analysis/assay的出现,为从分子水平解析这种黑箱提供了可能............

您可以就以下几方面展开讨论:
1、基本原理
2、具体实现方法/手段(如RNA-FISH、real competitive PCR、Pyrosequencing(or direct sequencing of RT-PCR products)、denaturing high-performance liquid chromatography、oligo array 、RT-PCR-SSCP 等)
3、应用领域(如SNPs功能、印记、致病等位基因检测、基因表达调控等)
4、优缺点
5、相关技术发展概况
6、在cell等杂志上的经典应用文献翻译与点评
7、其他

加分原则:

1. 你可以在此跟帖提问。如果你的问题有一定深度,引发战友们积极讨论和思考。加1-2分。

2. 回答问题或介绍经验。可加1-2分。

3. 精品论文导读(Cell,Nature,Science,Nature Genetics,PNAS等杂志上的更易加分),可加1-3分,即给出全文链接,且深入浅出介绍文章的主要内容加1分;且对文章的实验设计、结果和本文可能开展后续工作的介绍加2分;同时用流线图画出文章的技术路线、思路或结构的加3分

站友们在发知识性的帖子时,请注意标明“原创”或“转帖(及其来源)”。因为原创加分力度会大一点。多谢合作!

本版前期的明星技术:

1. 【交流】核酸版2005年7月份明星技术: In vitro site-specific mutagenesis

2. 【交流】核酸版2005年6月份明星技术: nuclear run on transcription

3. 【交流】核酸版2005年5月份明星技术: Switching Mechanism At 5' end of the RNA Transcript: SMART

4. 【交流】核酸版2005年4月份明星技术: Electrophoretic Mobility Shift Assay, EMSA

5. 【交流】核酸版2005年3月份明星技术:Chromatin immunoprecitation,ChIP

6. 【交流】核酸版2005年02月份明星技术:SELEX技术

7. 【交流】核酸版2005年元月份明星技术:Ribonuclease protection assay,RPA

8. 【交流】核酸版2004年12月份明星技术:Serial Analysis of Gene Expression,SAGE

9. 【交流】核酸版2004年10月份明星技术:DNA Microarray
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