【求助】关于ALK融合基因的检测
丁香园论坛
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各位大侠好,我是个实验的初学者。有个问题想求大家的帮助。我想检测一下石蜡标本中是否存在ALK融合基因的表达。ALK基因位于2p23,好像有6000多dp,ALK基因的多个外显子之间通常会有一些其他的基因融合其中从而会产生致瘤作用的融合蛋白。目前发现的可能会与ALK基因融合的其他基因有10来种,我想问一下怎样能够检测标本中是否存在这些融合基因的表达。我查过一些文献,有用FISH的,有用特异探针PCR的,有用免疫组化检测融合蛋白表达的,有用PCR直接测序法的....但FISH是不是只能检测已知的单个突变?免疫组化是不是特异性不强(即使是特异性较强的是不是也只能检测到一种融合突变)?那么PCR直接测序呢?
哪位大侠能不能帮我设计一下怎么能检测到已知和未知的ALK基因的融合突变?要用怎样的方法?各个方法的优缺点是什么?
谢谢大家了!原谅我的无知吧!我只是个初学者而已...
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推荐:FISH和免疫组织化学
FISH和免疫组织化学均可以一次检出不同类型的ALK基因转位,相对于PCR和RT—PCR要针对不同转位要设计不同引物而言,要简单的多。总的来说,在临床诊断中检测ALcL中有无ALK基因转位时。免疫组化由于其简单、快捷、价廉成为首选的方法;而FIsH由于能够在分子遗传学染色体水平上揭示ALK基因变异,准确性高,切片上进行的FIsH还可以部分保留组织学形态。结果形象直观,还可以通过增强洗脱条件很好地消除非特异性的结果,并可以在同一张切片上继续进行免疫组化实验等优势;在条件许可的情况下,也可以成为检测ALK基因变异的首选。
FISH和免疫组织化学均可以一次检出不同类型的ALK基因转位,相对于PCR和RT—PCR要针对不同转位要设计不同引物而言,要简单的多。总的来说,在临床诊断中检测ALcL中有无ALK基因转位时。免疫组化由于其简单、快捷、价廉成为首选的方法;而FIsH由于能够在分子遗传学染色体水平上揭示ALK基因变异,准确性高,切片上进行的FIsH还可以部分保留组织学形态。结果形象直观,还可以通过增强洗脱条件很好地消除非特异性的结果,并可以在同一张切片上继续进行免疫组化实验等优势;在条件许可的情况下,也可以成为检测ALK基因变异的首选。
请详细说一下各个方法的特点吧。能不能具体说一下各自检测单一突变或者多个突变的原理?
FISH不能检测突变,只能检测扩增、缺失和易位。
如果是针对肺癌的,ALK 的FISH融合探针(雅培)已经拿到FDA认证了,是辉瑞那个药的用药参考标准,你直接买就行了。不过最近价格翻了一倍(拿证的原因)。
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大侠可知道国内现在做这个靶点的检测费用是多少?谢谢
香港华创贸易国际有限公司北京办事处供应德国Zytolight ALK融合基因的FISH检测探针:
1、Z-2124-200 ZytoLight SPEC ALK Dual Color Break Apart Probe Green/Orange 200ul
Z-2124-50 ZytoLight SPEC ALK Dual Color Break Apart Probe Green/Orange 50ul
2、Z-2117-200 ZytoLight SPEC ALK/EML4 TriCheck# Probe Green/Orange/Blue 200ul
Z-2117-50 ZytoLight SPEC ALK/EML4 TriCheck# Probe Green/Orange/Blue 50ul
可以免费发送试用装,欢迎来电咨询。010-64484022、400-699-7909。info@huatron.net,www.huatron.net
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老师您好,这是我们的解决方案和与FISH的比较,您可以参考看看
CST公司开发了全新的高特异、高灵敏的针对ALK、ROS1融合蛋白的XP® 兔单克隆抗体和兔单克隆抗体【4,5】(见表1)。正是基于这种适于IHC检测的ALK融合蛋白抗体(克隆号D5F3,货号#3633),结合IHC技术比FISH更加简单实用和成熟普及,罗氏集团成员Ventana公司已于2012年初,与CST达成合作协议,共同开发了用于临床诊断ALK融合蛋白的IHC诊断试剂盒,为非小细胞肺癌病人的诊断和个性化治疗提供了有效的筛查工具。同样,以ROS1融合蛋白抗体(克隆号D4D6,货号#3287)为基础的IHC检测技术与断裂FISH方法相比,在非小细胞肺癌上IHC检测的准确度达到100%【5】。如此,我们期待检测ROS1融合变异的临床诊断用IHC试剂盒不久将成功推出。如要了解更多有关ALK和ROS1抗体的验证数据,请点击:ALK (D5F3) XP®Rabbit mAb #3633 和 ROS1 (D4D6) Rabbit mAb #3287。
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