【求助】有人用invitrogen的trizol 提取哺乳动物组织蛋白吗?效果如何?
丁香园论坛
1935
有人用invitrogen的trizol 提取哺乳动物组织蛋白吗?效果如何?
O(∩_∩)O谢谢 回复
O(∩_∩)O谢谢 回复
这个问题我刚好前段时间检索过,你可以参见两个丁香园的帖子:
1:http://www.dxy.cn/bbs/thread/4474660#4474660
2:http://www.dxy.cn/bbs/thread/6296746#6296746
另外的我其它地方查到的内容摘抄如下:
在用酒精沉淀出DNA(DNA抽提中的步骤一)后剩余的苯酚—乙醇上清中可以抽提出蛋白。沉淀的蛋白可通过蛋白[质]印迹法对样品中某一特殊的蛋白质进行分析。
试剂所需,但没有随同提供的物品:
~undefined 异丙醇
~undefined 0.3M盐酸胍(用95%酒精配制)
~undefined 无水乙醇
~undefined 1% SDS
1.蛋白质的沉淀
用异丙醇从苯酚—乙醇上清中沉淀蛋白(大约每1 ml TRIZOL试剂会剩下0.8 ml苯酚—乙醇上清液)。最初匀浆化时每1 ml TRIZOL试剂加1.5 ml异丙醇。将样品于15—30℃下放置10分钟,然后在2—8℃下以12,000×g的离心力离心10分钟。
2.蛋白质的洗涤
除去离心后的上清液并用0.3M盐酸胍(用95%酒精配制)洗涤蛋白沉淀3次。按照最初匀浆化时每1mlTRIZOL加2 ml洗涤液。在每一洗涤周期中,蛋白质和洗涤也要在15—30℃下作用20分钟然后在2—8℃下以7,500×g的离心力离心5分钟。最后的一次洗涤完成后,加2 ml无水乙醇旋涡振荡溶解蛋白沉淀,混合物在15—30℃下放置20分钟后再在2—8℃下以7,500×g的离心力离心5分钟。
3.蛋白质沉淀的再溶解
真空干燥蛋白质沉淀5—10分钟。移液管吸取1% SDS溶解蛋白质。要完全干燥蛋白质沉淀可能要求将蛋白质样品置于50℃洪箱中干燥。对于其中的任何不溶性的沉淀物可以在2—8℃下 10,000×g的离心力离心10分钟去除,并将上清液转移到一干净的试管中。这时样品已经可以用于Western blotting或保存于-5—-20℃为将来备用。
蛋白抽提注意事项:
1.溶于0.3M盐酸胍(用95%酒精配制)或者溶于无水乙醇中的蛋白质沉淀可以在2—8℃下存放至少一月,在-5—-20℃下至少存放一年。
2.以下均为更有效回收蛋白可选的方案。在2 — 8℃下用0.1% SDS透析苯酚-酒精上清液3次。以10,000×g的离心力高速冷冻离心透析后的物质10分钟,再用清洁的上清液做Western blotting。
3.只要SDS的浓度足够低(<0.1%)不至于干扰测定,蛋白质就可以用Bradford法进行定量分析。没有洗涤剂干扰的方法,不依赖A260/A280值测量蛋白质含量的方法均可使用(因为残留的痕量苯酚可能使得蛋白质的浓度被高估)。
疑难解答:
蛋白质抽提
?产量低
1.样品匀浆化或裂解不完全。
2.终DNA不完全再溶解。
?蛋白质降解
从动物身上取下的组织没有立即处理或冰冻
? PAGE上的条带变形
蛋白质沉淀洗涤不充分
1:http://www.dxy.cn/bbs/thread/4474660#4474660
2:http://www.dxy.cn/bbs/thread/6296746#6296746
另外的我其它地方查到的内容摘抄如下:
在用酒精沉淀出DNA(DNA抽提中的步骤一)后剩余的苯酚—乙醇上清中可以抽提出蛋白。沉淀的蛋白可通过蛋白[质]印迹法对样品中某一特殊的蛋白质进行分析。
试剂所需,但没有随同提供的物品:
~undefined 异丙醇
~undefined 0.3M盐酸胍(用95%酒精配制)
~undefined 无水乙醇
~undefined 1% SDS
1.蛋白质的沉淀
用异丙醇从苯酚—乙醇上清中沉淀蛋白(大约每1 ml TRIZOL试剂会剩下0.8 ml苯酚—乙醇上清液)。最初匀浆化时每1 ml TRIZOL试剂加1.5 ml异丙醇。将样品于15—30℃下放置10分钟,然后在2—8℃下以12,000×g的离心力离心10分钟。
2.蛋白质的洗涤
除去离心后的上清液并用0.3M盐酸胍(用95%酒精配制)洗涤蛋白沉淀3次。按照最初匀浆化时每1mlTRIZOL加2 ml洗涤液。在每一洗涤周期中,蛋白质和洗涤也要在15—30℃下作用20分钟然后在2—8℃下以7,500×g的离心力离心5分钟。最后的一次洗涤完成后,加2 ml无水乙醇旋涡振荡溶解蛋白沉淀,混合物在15—30℃下放置20分钟后再在2—8℃下以7,500×g的离心力离心5分钟。
3.蛋白质沉淀的再溶解
真空干燥蛋白质沉淀5—10分钟。移液管吸取1% SDS溶解蛋白质。要完全干燥蛋白质沉淀可能要求将蛋白质样品置于50℃洪箱中干燥。对于其中的任何不溶性的沉淀物可以在2—8℃下 10,000×g的离心力离心10分钟去除,并将上清液转移到一干净的试管中。这时样品已经可以用于Western blotting或保存于-5—-20℃为将来备用。
蛋白抽提注意事项:
1.溶于0.3M盐酸胍(用95%酒精配制)或者溶于无水乙醇中的蛋白质沉淀可以在2—8℃下存放至少一月,在-5—-20℃下至少存放一年。
2.以下均为更有效回收蛋白可选的方案。在2 — 8℃下用0.1% SDS透析苯酚-酒精上清液3次。以10,000×g的离心力高速冷冻离心透析后的物质10分钟,再用清洁的上清液做Western blotting。
3.只要SDS的浓度足够低(<0.1%)不至于干扰测定,蛋白质就可以用Bradford法进行定量分析。没有洗涤剂干扰的方法,不依赖A260/A280值测量蛋白质含量的方法均可使用(因为残留的痕量苯酚可能使得蛋白质的浓度被高估)。
疑难解答:
蛋白质抽提
?产量低
1.样品匀浆化或裂解不完全。
2.终DNA不完全再溶解。
?蛋白质降解
从动物身上取下的组织没有立即处理或冰冻
? PAGE上的条带变形
蛋白质沉淀洗涤不充分
谢谢,您的回复我也有看到,就是不知 1% SDS溶解蛋白质的需要量有么有特殊要求? 我想同时提取小鼠不同组织中RNA和蛋白,用于RT-PCR和WB,但是前期保存的组织是离体后一小时才放入液氮中,不知取材这步对后续试验影响大吗?
溶解蛋白时用量自己控制就好了。我感觉能吧蛋白全部溶解就行。
组织在外面应该也是放冰上的吧,1小时应该没问题
组织在外面应该也是放冰上的吧,1小时应该没问题
本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你,都可以成为师兄的好伙伴
师兄微信号:shixiongcoming