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【求助】siRNA CDNA的扩增 谢谢

丁香园论坛

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各位大侠 像高手请教两个问题,我以前帮过很多别人呢,希望高手们指导一下:
一 我想做siRNA方面的实验,想直接合成siRNA,然后用脂质体转染,想请问是不是直接合成 21bp的正义链和反义链互补的siRNA,然后用不用退火使两者形成双链,是直接转染合成的两个单链呢 还是转染退火以后的双链siRNA?
二 如果我想重cDNA用PCR获得目的基因,因为CDNA是不含有内含子的,但又含有5,端和3,端得非编码区,那我设计引物的时候是不是必须也扩增出5,端和3,端的非编码区,如果不扩增的话到时候有CDNA转录的mRNA会不会结合不到翻译复合体上?,想请问你们扩增cDNA的时候是怎样设计引物的?
三 有哪位高人能帮我查一下vEGFR(血管源性内皮生长因子受体)的mRNA序列和基因序列 万分感谢
一, siRNA请其他更有经验的回答。

二, 如果是只要获得目的基因的编码蛋白质的基因序列,就不用扩增5’和3’UTR, 直接把引物设计在从ATG到stop codon就可以了,如果必要就加上酶切位点。然后连接到载体上面去(注意连接避免移码),一般载体上已经含有翻译转录的一些必需元件,这个就不用担心翻译不出来了。

三, 去NCBI自己先搜看看吧 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
siRNA: you need to anneal single strand RNA to form double strand siRNA, and then transfect the annealed double strand siRNA into your cells.
thank you very much ,does the synthesize company could synthesize the single strand RNA ? Have you ever done such experiments? looking for your rewards
Many company can synthesize RNA, you can simple take a look at their website, and they should have their protocol of how to use it.

normally I use shRNA (expressed from a vector) instead of siRNA.

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师兄微信号:shixiongcoming

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