【求助】microRNA后带有星号和不带有星号的代表什么意思
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microRNA后带有星号和不带有星号的代表什么意思,例如miR-200a与miR-20undefined。请赐教!
你可以上Sanger网站去查,在一定程度上指的是他们是互补序列而已,没有其他的意思。
谢谢版主
没有星号代表的是成熟MICROrna的主要产物
When the relative abundancies clearly indicate which is the predominantly expressed miRNA, the mature sequences are assigned names of the form miR-56 (the predominant product) and miR-5undefined (from the opposite arm of the precursor).
When the relative abundancies clearly indicate which is the predominantly expressed miRNA, the mature sequences are assigned names of the form miR-56 (the predominant product) and miR-5undefined (from the opposite arm of the precursor).
关于microRNA的命名规则:
(1)miRNA 简写成miR,再根据其被克隆的先后顺序加上阿拉伯数字,如miR-21;
(2)高度同源的miRNA 在数字后加上英文小写字母(a、b 、c),如miR-199a 和miR-199b;
(3)由不同染色体上的DNA序列转录加工而成的具有相同成熟体序列的miRNA,则在后面加上阿拉伯数字以区分, 如miR-199a-1 和miR-199a-2;
(4)如果一个前体的2 个臂分别加工产生miRNA,则根据克隆实验,在表达水平较低的miRNA 后面加“”,如miR-199a和miR-199undefined,或进行如下命名,miR-142-5p(也可命名为miR-142-s,表示从5' 端的臂加工而来)和miR-142-3p(也可命名为miR-142-as,表示从3´端的臂加工而来);
(5)将物种缩写置于miRNA 之前,如hsa-miR-1 9 5 ;
(6)确定命名规则之前发现的miRNA,如let-7,则保留原来名字。
引自周凡,庄诗美.《microRNA与肿瘤》, 生命科学, 2008, 20(2):207-212.
(1)miRNA 简写成miR,再根据其被克隆的先后顺序加上阿拉伯数字,如miR-21;
(2)高度同源的miRNA 在数字后加上英文小写字母(a、b 、c),如miR-199a 和miR-199b;
(3)由不同染色体上的DNA序列转录加工而成的具有相同成熟体序列的miRNA,则在后面加上阿拉伯数字以区分, 如miR-199a-1 和miR-199a-2;
(4)如果一个前体的2 个臂分别加工产生miRNA,则根据克隆实验,在表达水平较低的miRNA 后面加“”,如miR-199a和miR-199undefined,或进行如下命名,miR-142-5p(也可命名为miR-142-s,表示从5' 端的臂加工而来)和miR-142-3p(也可命名为miR-142-as,表示从3´端的臂加工而来);
(5)将物种缩写置于miRNA 之前,如hsa-miR-1 9 5 ;
(6)确定命名规则之前发现的miRNA,如let-7,则保留原来名字。
引自周凡,庄诗美.《microRNA与肿瘤》, 生命科学, 2008, 20(2):207-212.
zhujoker wrote:
你可以上Sanger网站去查,在一定程度上指的是他们是互补序列而已,没有其他的意思。
zhoujueyu wrote:
关于microRNA的命名规则:
(1)miRNA 简写成miR,再根据其被克隆的先后顺序加上阿拉伯数字,如miR-21;
(2)高度同源的miRNA 在数字后加上英文小写字母(a、b 、c),如miR-199a 和miR-199b;
(3)由不同染色体上的DNA序列转录加工而成的具有相同成熟体序列的miRNA,则在后面加上阿拉伯数字以区分, 如miR-199a-1 和miR-199a-2;
(4)如果一个前体的2 个臂分别加工产生miRNA,则根据克隆实验,在表达水平较低的miRNA 后面加“”,如miR-199a和miR-199undefined,或进行如下命名,miR-142-5p(也可命名为miR-142-s,表示从5' 端的臂加工而来)和miR-142-3p(也可命名为miR-142-as,表示从3´端的臂加工而来);
(5)将物种缩写置于miRNA 之前,如hsa-miR-1 9 5 ;
(6)确定命名规则之前发现的miRNA,如let-7,则保留原来名字。
引自周凡,庄诗美.《microRNA与肿瘤》, 生命科学, 2008, 20(2):207-212.
以上有误或不完整,进一步纠正或说明一下:miRNA前体两臂上产生的两个miRNA,研究者将丰度较低的miRNA加以“*”标记,而当前未通过实验确定丰度高低的,以诸如miR-142-5p(5‘臂)和miR-142-3p(3‘臂)这种命名形式来区分。
请问一下丰度在这里指的是什么?
谢谢各位回答,我也想知道丰度具体是什么意思。
wu_g_f wrote:
谢谢各位回答,我也想知道丰度具体是什么意思。
这里指检测到的miRNA表达量。
留个就脚印
原来是这样,以前也是没弄明白,它们的区别,很感谢
学习了。
谢谢!说得不错啊!
很好,长见识了,呵呵
了解,MIRNA和siRNA主要是什么区别 呢?
好。。。
今天的收获真的不小 呵呵
终于弄明白miRNA的各种命名方法,十分感谢!
长见识了。谢谢各位!
受教了,非常感谢
mark,好贴!
When relative expression levels are known, an asterisk following the name indicates an miRNA expressed at low levels relative to the miRNA in the opposite arm of a hairpin. For example, miR-123 and miR-12undefined would share a pre-miRNA hairpin, but relatively more miR-123 would be found in the cell.
http://en.wikipedia.org/wiki/MicroRNA
http://en.wikipedia.org/wiki/MicroRNA
好东西,长见识
谢谢指点,问题虽小,但很实用
mark!
microRNA106-b~25的~25,是什么意思?
终于明白了,谢谢
研究带星号的microRNA有没有意义呢,我看到文献测得表达谱中有一个带星号的microRNA表达明显差异。
谢谢!
学习了,谢谢各位老师!
学习了,谢谢各位老师!
非常感谢
星号与否其实是两个不同的miRNA基因了,功能也是很不同的。
学习了!!
正在学习,O(∩_∩)O谢谢
谢谢各位的讲解,一直想弄清这个问题。
miRNA的命名原则和它与siRNA主区别出处
谢谢,非常有用!
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