【求助】请教一下比较经典的对某个特定miRNA调控的例子
丁香园论坛
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我想题目没说清楚。。。
是这样的,我们做了一个方法,现在要检测这个方法的好坏,需要知道特定的miRNA的上调或者下调。我们希望能找到一些比较经典对某个miRNA调控的例子。经典的意思是:
1. 这个调控比较可靠,大家公认。比如某个TF会激活某个miRNA的表达。
2. 这个调控涉及的分子比较重要。比如上面例子里面的TF是P53。
因为做的比较偏方法,要找具体的例子还一下子没有谱了,麻烦大家给点建议。谢谢!
是这样的,我们做了一个方法,现在要检测这个方法的好坏,需要知道特定的miRNA的上调或者下调。我们希望能找到一些比较经典对某个miRNA调控的例子。经典的意思是:
1. 这个调控比较可靠,大家公认。比如某个TF会激活某个miRNA的表达。
2. 这个调控涉及的分子比较重要。比如上面例子里面的TF是P53。
因为做的比较偏方法,要找具体的例子还一下子没有谱了,麻烦大家给点建议。谢谢!
鉴定调控miRNA的TF最常用的方法还是CHIP,
关于miRNA的自身表达调控分析已有很多文献了
关于miRNA的自身表达调控分析已有很多文献了
小结:
1. miRNA的基因与蛋白编码基因一样,具有典型的5'转录调控区与3‘UTR,以及polyA加尾,
2. miRNA的转录调控分析与蛋白编码基因类似,确定转录起始位点,报告基因检测得到核心调控区,生物信息学分析TF,CHIP验证
3. miRNA的转录调控的信号通路分析也像蛋白编码基因一样,可以设计多种条件,如加生长因子,药物等等。。。。。。。
4.一篇好的miRNA的转录调控文章,我想应该包括上游通路-转录因子-miRNA-靶基因-生物学效应(体内或体外实验)
不足之处,请其他战友补充!
1. miRNA的基因与蛋白编码基因一样,具有典型的5'转录调控区与3‘UTR,以及polyA加尾,
2. miRNA的转录调控分析与蛋白编码基因类似,确定转录起始位点,报告基因检测得到核心调控区,生物信息学分析TF,CHIP验证
3. miRNA的转录调控的信号通路分析也像蛋白编码基因一样,可以设计多种条件,如加生长因子,药物等等。。。。。。。
4.一篇好的miRNA的转录调控文章,我想应该包括上游通路-转录因子-miRNA-靶基因-生物学效应(体内或体外实验)
不足之处,请其他战友补充!
谢谢楼上的各位, 这两篇文章我还没看,不过第二篇跟p53调控有关联,倒是挺不错。
我们做的是个通用的东西,在深度上倒是没有太多东西。觉得miRNA调控什么的还是太细了,也许该去过一下TarBase。
唯一比较通用的,就是知道miRNA有组织特异的表达,目前我们还是根据这个来推断miRNA的表达状态。
我们做的是个通用的东西,在深度上倒是没有太多东西。觉得miRNA调控什么的还是太细了,也许该去过一下TarBase。
唯一比较通用的,就是知道miRNA有组织特异的表达,目前我们还是根据这个来推断miRNA的表达状态。
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