大魚sky
求助 :已知一个基因和相关的两个miRNA,有一个过表达的病毒,请问现在怎么做能够从动物上找到这两个miRNA与基因之间的上下游关系?
dxyc42u
首先过表达之后做qpcr看看这几个基因之间是否有关系,再做荧光素酶检测看看是否有直接关系
毛利小五郎的徒弟
可以联系病毒和上游下游rna,看基因调控对病毒的抑制作用。
loveliufudan
针对您的问题,可以考虑以下步骤:
构建过表达该基因的病毒,并在动物模型中进行感染;
对感染后的组织样本进行RNA提取,并进行miRNA和基因的测量,比如qPCR或者RNA-seq;
根据miRNA和基因的表达数据,进行相关性分析,比如Spearman相关性分析或者Pearson相关性分析,以确定这两个miRNA与该基因之间的上下游关系;
进一步验证这两个miRNA对该基因的调控作用,可以采用miRNA靶向实验或者基因敲除实验等方法进行。
需要注意的是,以上步骤只是一个简单的参考,具体操作还需要根据实验具体情况和数据分析结果进行调整和修改。
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