【求助】这几组microrna有什么区别？

hsa-miR-625　和hsa-miR-62undefined
hsa-mir-532-5p 和hsa-miR-532-3p
hsa-mir-34a 和　hsa-mir-34b　　（同源？？）
hsa-let-7a-2 和　hsa-let-7a-1　　（分布不同？？）

晕了，赐教啊

hsa-miR-625　和hsa-miR-62undefined
这2个第一个你应该清楚吧，hsa-miR-62undefined表示和前面那个互补的miRNA，于是就用了一个号标记。
hsa-mir-532-5p 和hsa-miR-532-3p
其实和上面也没有太大的差别，hsa-mir-532-5p就是在茎环结构的5‘端，而hsa-miR-532-3p是在茎环结构的3‘端，并且他们是互补的。且是同一基因转录出来的。
hsa-mir-34a 和　hsa-mir-34b　These names have been remapped to miR-34c (MI0000403 ), miR-34b (MI0000404 ) and miR-34a (MI0000584 ) to clarify homology with human sequences.
hsa-let-7a-2 和　hsa-let-7a-1　　（分布不同？？）
其实这2个就是他们的前体不一样，而最后成熟体一致的，都是hsa-let-7a。
个人观点，仅供参考，更多资讯请看http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=154&id=14447767&sty=1&tpg=1&age=0

非常感谢zhujoker，还有一个小小的问题，就是既然那组和p那组一样，为什么mirbase数据库还要分开呢？为什么不统一一下呢？

对于你的这个问题，其实我也是一直存在这种想法的，就是没有去探究而已，经你这样一说，我又看了一下mirbase数据库，感觉他们的确没有什么差异的，记得第一次看见hsa-miR-62undefined这样标记的是在plosone杂志上，上面说了是hsa-miR-625的互补序列。但是在用到像hsa-mir-532-5p 和hsa-miR-532-3p标记时，是实验室的一个同学构建miRNA表达质粒上遇到的，所以也就略知一二。但是他们之间到底有什么差异，我看了一些，没有找到，因为好像有的是用的hsa-miR-625　和hsa-miR-62undefined，而另外一些是用的hsa-mir-532-5p 和hsa-miR-532-3p，而在一些文献上没有特别的说明，比如现在mirbase数据库上的hsa-miR-17用的是hsa-miR-17和hsa-miR-1undefined，但是在一篇最新（09.5.4）的gene development上一篇文章（The miR-200 family determines the epithelial phenotype of cancer cells by targeting the E-cadherin repressors ZEB1 and ZEB2）中用到的是hsa-miR-17-3p，呵呵，这个到底有没有差异我想应该是没有的。应该最后会统一的吧，或者说他们真正的有差别，但是我不知道，呵呵。希望有知道一起分享一下。但是现在比较流行用hsa-mir-532-5p 和hsa-miR-532-3p，可能这也是最后的版本吧。

希望版主将此贴移至“【讨论】microRNA研究交流贴：别讨论引物设计实验操作等问题！ [精华]”

多谢zhujoker哈，又有个问题，在mirbase上最近的版本中有两条序列是这样的
hsa-mir-103-2-as
hsa-mir-103-1-as

这是什么意思呢？

这个帖子很好！虽然我用mirbase也有一段时间了，对这些问题其实没有想很深。

hsa-miR-625　和hsa-miR-62undefined
hsa-mir-532-5p 和hsa-miR-532-3p

对于这个，我的认识是在pre-mirna被Dicer加工成两个短链之后，一般来说，其中的一条被认为是成熟的miRNA序列，而另外一条被认为是序列。miRBase里面的MATURE SEQUENCE只有非星号的序列。在我看过的很多paper里面，基本只考虑这个成熟序列。至于为什么，我也一直没有明白:(

对于用3p和5p标注的，似乎是两条都被认为是有效的mature sequence，miRBase里面都列为MATURE SEQUENCE。

hsa-mir-34a 和　hsa-mir-34b　　（同源？？）
hsa-let-7a-2 和　hsa-let-7a-1　　（分布不同？？）
这个zhujoker 解释了，但是更一般意义上说呢？ 就我的一点经验来看，-1，-2，-3后缀的成熟序列往往是一样的，但是a,b,c这样后缀的，我一直不清楚什么关系。比如mmu-miR-208a和mmu-miR-208b的mature sequence就略微不一样。我的体会是，可能-1,-2,-3是指pre-mirna序列不同，但是mature序列一致；而a,b,c后缀指几个mature序列很相近的miRNA（而且很可能它们的seed序列一致，所以才能算成一个miRNA）

至于as后缀，我还没在实际中见过。

希望了解命名规则的朋友能讲一讲，给大家解惑。

学习了~

学习了，谢谢~

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