【求助】microRNA和siRNA有多少区别啊?
丁香园论坛
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对RNA正在学习中,有点搞不明白microRNA和siRNA了,两个有多少不同点呢?请高手指教啦!
推荐你去看一下,这个帖子,里面楼主归纳了很多关于miRNA知识!
http://news.dxy.cn/bbs/thread/10069790?keywords=非编码RNA的研究现状PPT#10069790
http://news.dxy.cn/bbs/thread/10069790?keywords=非编码RNA的研究现状PPT#10069790
我查了点资料,共同学习:
小的干涉RNA(small interfering RNA; siRNA) 和微小RNA(microRNA;miRNA)是两种序列特异性地转录后基因表达的调节因子,是小RNA的最主要组成部分,它们的相关性密切,既具有相似性,又具有差异性。对小RNA的深入研究将使我们更深一步了解生命的奥秘。本文主要介绍这两种小RNA分子及其作用机理。
RNA干涉(RNAi)在实验室中是一种强大的实验工具,通过这种方式,利用具有同源性的双链RNA(dsRNA)诱导序列特异的目标基因的沉默,迅速阻断基因活性。小的干涉RNA(siRNA)是在RNA干涉过程中人工体外合成的小片段RNA,由约20个碱基对组成,包括5个磷酸盐,2个核苷和3个悬臂。siRNA在RNA沉默通道中起中心作用,是对特定信使RNA(mRNA)进行降解的指导要素。
miRNAs是一种21-25nt长的单链小分子RNA,其结构特征如下:广泛存在于真核生物中,是一组不编码蛋白质的短序列RNA,它本身不具有开放阅读框(ORF);成熟的miRNA,5′端有一个磷酸基团,3′端为羟基,是由具有发夹结构的约70-90个碱基大小的单链RNA前体经过Dicer酶加工后生成,不同于siRNA(双链)但是和siRNA密切相关。成熟的miRNA 5’端的磷酸基团和3?端羟基则是它与相同长度的功能RNA降解片段的区分标志。miRNA独有的特征是其5'端第一个碱基对U有强烈的倾向性,而对G却有抗性,但第二到第四个碱基缺乏U,一般来讲,除第四个碱基外,其他位置碱基通常都缺乏C。MiRNAs具有高度的保守性、时序性和组织特异性。 在科研上,一个小RNA分子要成为miRNA,需要符合以下条件:a)表达需要用Northern-blot来证实;b)小RNA分子必须是处在具发夹结构的前体RNA分子中远离环或膨胀部分的一端才行;c)小RNA分子必须在系统发育上具备相当的保守性。d)前体RNA分子会在Dicer功能下降时积累起来(该项标准由于实践较难,只做参考)。这些标准单独一条不足以证明一个未知小RNA分子是否就是是miRNA,具体地,如果小RNA分子符合上面的a(表达)和b(结构)两条标准;或者a(表达)和c(保守性);如果表达量很低难以检测,那么如果可以用cDNA克隆的方法得到目标分子,并符合c(保守性);小RNA分子如果不是通过cDNA克隆的方法得到的,那么就必须符合a(表达)和前体RNA分子结构和保守性的标准才行;如果小RNA分子被推测为miRNA,那么符合c(系统发育保守性)和d(累积性)标准也行;这样我们就可以认为该小RNA分子就是miRNA分子。
《基因Ⅷ》中关于microRNA(小RNA)与siRNA(短干涉RNA)的异同:
不同点:
a.根本区别是miRNA是内源性的,是生物体的固有因素;而siRNA是人工体外合成的,通过转染进入体内,是RNA干涉的中间产物;
b.结构上,miRNA是单链RNA,而siRNA是双链RNA;
c.Dicer酶对二者的加工过程不同,miRNA是不对称加工,miRNA仅是剪切pre—miRNA的一个侧臂,其他部分降解;而siRNA对称地来源于双链RNA的前体的两侧臂;
d.在作用位置上,而siRNA可作用于mRNA的任何部位;
e.在作用方式上,miRNA可抑制靶标基因的翻译,也可导致靶标基因降解,即在转录水平后和翻译水平起作用;而siRNA只能导致靶标基因的降解,即为转录水平后调控;(J.D.Watson的《基因的分子生物学》上,认为microRNA是在植物及线虫中最广泛的一种特征。通过转录本产生的miRNA导致了与其有同源性的靶mRNA的破坏(在植物中)或转录抑制(在线虫中);siRNA的作用:引起mRNA的破坏,抑制了其mRNA的翻译;或者促使了启动子内的染色质的修饰,使得基因沉默。)
f.miRNA主要在发育过程中起作用,调节内源基因表达,而siRNA不参与生物生长,是RNAi的产物,原始作用是抑制转座子活性和病毒感染。
相同点:
a.二者的长度都约在22nt左右;
b.二者都依赖Dicer酶的加工,是Dicer的产物;
c.二者生成都需要Argonaut家族蛋白存在;
d.二者都是RISC组分,所以功能界限不清晰,如二者在介导沉默机制上有重叠;
e.miRNA和siRNA合成都是由双链RNA或RNA前体形成的。
小的干涉RNA(small interfering RNA; siRNA) 和微小RNA(microRNA;miRNA)是两种序列特异性地转录后基因表达的调节因子,是小RNA的最主要组成部分,它们的相关性密切,既具有相似性,又具有差异性。对小RNA的深入研究将使我们更深一步了解生命的奥秘。本文主要介绍这两种小RNA分子及其作用机理。
RNA干涉(RNAi)在实验室中是一种强大的实验工具,通过这种方式,利用具有同源性的双链RNA(dsRNA)诱导序列特异的目标基因的沉默,迅速阻断基因活性。小的干涉RNA(siRNA)是在RNA干涉过程中人工体外合成的小片段RNA,由约20个碱基对组成,包括5个磷酸盐,2个核苷和3个悬臂。siRNA在RNA沉默通道中起中心作用,是对特定信使RNA(mRNA)进行降解的指导要素。
miRNAs是一种21-25nt长的单链小分子RNA,其结构特征如下:广泛存在于真核生物中,是一组不编码蛋白质的短序列RNA,它本身不具有开放阅读框(ORF);成熟的miRNA,5′端有一个磷酸基团,3′端为羟基,是由具有发夹结构的约70-90个碱基大小的单链RNA前体经过Dicer酶加工后生成,不同于siRNA(双链)但是和siRNA密切相关。成熟的miRNA 5’端的磷酸基团和3?端羟基则是它与相同长度的功能RNA降解片段的区分标志。miRNA独有的特征是其5'端第一个碱基对U有强烈的倾向性,而对G却有抗性,但第二到第四个碱基缺乏U,一般来讲,除第四个碱基外,其他位置碱基通常都缺乏C。MiRNAs具有高度的保守性、时序性和组织特异性。 在科研上,一个小RNA分子要成为miRNA,需要符合以下条件:a)表达需要用Northern-blot来证实;b)小RNA分子必须是处在具发夹结构的前体RNA分子中远离环或膨胀部分的一端才行;c)小RNA分子必须在系统发育上具备相当的保守性。d)前体RNA分子会在Dicer功能下降时积累起来(该项标准由于实践较难,只做参考)。这些标准单独一条不足以证明一个未知小RNA分子是否就是是miRNA,具体地,如果小RNA分子符合上面的a(表达)和b(结构)两条标准;或者a(表达)和c(保守性);如果表达量很低难以检测,那么如果可以用cDNA克隆的方法得到目标分子,并符合c(保守性);小RNA分子如果不是通过cDNA克隆的方法得到的,那么就必须符合a(表达)和前体RNA分子结构和保守性的标准才行;如果小RNA分子被推测为miRNA,那么符合c(系统发育保守性)和d(累积性)标准也行;这样我们就可以认为该小RNA分子就是miRNA分子。
《基因Ⅷ》中关于microRNA(小RNA)与siRNA(短干涉RNA)的异同:
不同点:
a.根本区别是miRNA是内源性的,是生物体的固有因素;而siRNA是人工体外合成的,通过转染进入体内,是RNA干涉的中间产物;
b.结构上,miRNA是单链RNA,而siRNA是双链RNA;
c.Dicer酶对二者的加工过程不同,miRNA是不对称加工,miRNA仅是剪切pre—miRNA的一个侧臂,其他部分降解;而siRNA对称地来源于双链RNA的前体的两侧臂;
d.在作用位置上,而siRNA可作用于mRNA的任何部位;
e.在作用方式上,miRNA可抑制靶标基因的翻译,也可导致靶标基因降解,即在转录水平后和翻译水平起作用;而siRNA只能导致靶标基因的降解,即为转录水平后调控;(J.D.Watson的《基因的分子生物学》上,认为microRNA是在植物及线虫中最广泛的一种特征。通过转录本产生的miRNA导致了与其有同源性的靶mRNA的破坏(在植物中)或转录抑制(在线虫中);siRNA的作用:引起mRNA的破坏,抑制了其mRNA的翻译;或者促使了启动子内的染色质的修饰,使得基因沉默。)
f.miRNA主要在发育过程中起作用,调节内源基因表达,而siRNA不参与生物生长,是RNAi的产物,原始作用是抑制转座子活性和病毒感染。
相同点:
a.二者的长度都约在22nt左右;
b.二者都依赖Dicer酶的加工,是Dicer的产物;
c.二者生成都需要Argonaut家族蛋白存在;
d.二者都是RISC组分,所以功能界限不清晰,如二者在介导沉默机制上有重叠;
e.miRNA和siRNA合成都是由双链RNA或RNA前体形成的。
太感谢楼上的回复了
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