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【求助】siRNA和质粒转染有何区别

丁香园论坛

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请问各位:siRNA和质粒转染有何区别?
我最近在做siRNA使某个基因沉默,用的是santa的商业合成的siRNA,我导师想让我做质粒转染,我不知道这两者有何区别,目的不都是沉默某个基因表达吗?
请各位指教
希望各位高手指点小妹!我很迷茫
siRNA只能做瞬转,而用质粒的话可以建立稳转株。其目的都是沉默目的蛋白的。
差别就是这些吗?
转染是一种实验手段,就是把核酸转移进入细胞,sRNAi是把小RNA转染进入细胞,通常说的转染是将质粒转移进入细胞,只不过两者目的不同,sRNAi目的是沉默基因,通常说的转染是表达蛋白。
首先应该好好看看两者的定义。

我只有理论上说两句供你参考:

1、你可以直接转入合成的sRNAi片段,其实最初的sRNAi技术就是这么做的。但是这样的效率不高,且不够稳定。重复性差。条件苛刻,也就是不容易做好。
2、将sRNAi片段插入适当的质粒基因组中,让质粒将它带入靶细胞,因为质粒可以自行复制,入细胞后可以复制、表达自己基因组中的基因(包括插入的sRNAi),这样就可以使细胞内的sRNAi片段多起来,达到发挥作用的浓度。(虽然这个浓度不要求很高,但这种方式肯定比直接转染sRNAi片段多,且有效。)
3、将你的sRNAi连上质粒基因组后转进去表达(利用的这个质粒叫:载体),是长久还是瞬时?这要取决于质粒(载体)。严格的说除了立逆转录病毒载体,其他的都是瞬时的表达,细胞传代后均有可能消失。当做也不排除有较稳定的(在选择压力下,比如新霉素抗性等,或者营养依赖,选择等)。
4、利用质粒进行sRNAi,因为质粒上可能有标记,便于检测你的效果。

建议先理论弄明白,做的过程中出现问题便于分析。
另外,为何不直接问导师为什么呢?要不耻“上”问呀,学生问老师,有什么不好意思?
siRNA持续时间比较短,质粒的话就可以筛选稳定抑制的细胞系 了。
不过,我用稳定表达siRNA的质粒构建稳定细胞系,最后筛出来的抗药细胞只有两株目的基因被抑制到30%左右。
请问大家,目的基因未被抑制的那些细胞株,可不可以做为我的抑制株的对照?按道理来讲,应该用稳定表达随机siRNA的质粒同时构建稳定细胞系,做为我的对照。现在重新单独构建对照细胞系可以吗?
楼上说的很对
商业合成的siRNA是用化学方法直接合成的,通常就是一对大概23bp的双链RNA,它可以在细胞内诱导接连成小RNA 即我们常说的沉默RNA,用于直接沉默目的基因的转录体,迅速高效但是沉默时间是瞬时的,而用质粒载体时,需要构建表达载体,载体上选择合适的启动子,报告基因 和有效的沉默序列是必要的。表达载体一般能在细胞内或体内稳定存留一段时间。可以稳定表达沉默片段,从而达到沉默基因的目的。
一个是RNA一个是DNA, sirna的 功能是有一定时限的,不可能长时间 时限沉默功能,而质粒转然之后 只要不出现质粒丢失现象是可以长时间实现功能的,另外 他们两个的转染试剂可能也不同,一般 siRNA有专门的 特异性转染试剂,目的是为了实现更高的转染效率
学习了
学习了。请问有谁做过结肠癌细胞株HCT116的质粒转染吗?一般优化条件是多少?
用siRNA 就只能做到瞬时干扰掉靶基因, 没做一次实验都要干扰一次 但是不能保证你每次的干扰效率都比较好 所以就做后续的实验就比较麻烦,而用shRNA 也就是构建到载体中的siRNA就可以用来构建稳定株 做后续实验也会方便稳定些 并且做的实验的范围就会更广些,比如用来包装病毒然后做动物实验啊 等等 这就要根据你的后续实验需要了
那转染方法有什么区别呢?
学习了。。。

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