【求助】请教大家一个关于基因启动子的问题

本人正在进行一种物质的研究，该物质可以进入作用于特定基因的启动子序列，抑制顺式或反式作用因子与启动子序列的结合，从而影响该基因的表达。现在两个问题请教
各位大侠：
1、不同类型的细胞（比如内皮细胞和血管平滑肌细胞）的同一种基因的启动子序列是不是同样的结构，即一、二、三级结构是不是都是一样的？
2、不同类型的细胞（比如内皮细胞和血管平滑肌细胞）应该有着同样的核染色体，那么为什么在同样的刺激因素作用下（比如说应激），不同类型的细胞的同一基因的表达情况是不一样的？
请各位细胞生物、分子生物的高手百忙之中帮助回答一下，不胜感激！

1. 你说的启动子结构是什么意思？启动子就是一段DNA序列，我认为它就没有什么一级、二级、三级结构；不同类型的细胞或者细胞器一般来讲，DNA拷贝都应该是一样的序列，我只说通常来讲哈，因为细胞器这类就不好说，线粒体和叶绿体啥的就很特别，我不知道是否有些细胞也很特别。
2. 这个问题是一个很经典的调控问题，也是很常见的。发育调控是个最好的例子。不考虑其他因素，只考虑基因的特异性时空表达。以果蝇为例，在该发育眼睛的地方只有某一部分基因表达，要是发生异常，长眼睛的地方就有可能长出腿来，这个教科书上的例子大家还记得吧。呵呵。另外一个例子，长期进化和对环境的适应性，尽管不同细胞具有相同染色体，但是在特定的环境下，染色体某些区域就处于失活状态，不能被表达。常染色质/异染色质，以及Xist就是典例。

表观遗传学是很重要的知识。。。。

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