Western转膜步骤
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下面的步骤适用于通过Xcell Ⅱ转印系统进行蛋白印记的大部分应用。为达到最佳效果,用户的优化是必要的。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
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II. 规格: 转印槽尺寸: 14.5cm x 14cm x 11cm Blot Module容积:约200ml 下缓冲液槽容积:600ml Blot尺寸: 约9cundefined9cm 注意:在以下步骤中,应该始终使用手套以避免凝胶和膜的污染,并防止接触电泳和电转过程中常用的刺激物。 |
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Ⅲ 材料制备 a) 转膜缓冲液- 请注意对大多数转膜我们推荐使用强度减半的Towbin缓冲液,其中含有20%的甲醇。使用Xcell Ⅱ转印系统进行成功的转膜,0.5Xtowbin缓冲液就可以提供足够的离子强度,而不产生过多的热量。这种缓冲液可能不适合其它的转印系统,反过来也是这样。一升的转膜缓冲液制备方法如下( 含20%甲醇的0.5X Towbin) |
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请参看invitrogen目录648页制备NuPAGE®转膜缓冲液。 b) 制备转印垫- 用大约700ml的转印缓冲液浸泡转印垫至饱和,浸泡在缓冲液中时注意挤压转印垫去除气泡,这一步骤是必需的,因为不去除气泡可能会阻碍生物分子的转印。 c) 制备转印膜和滤纸- 将选择的转印膜和滤纸按凝胶尺寸裁好或使用预先裁好的膜/滤纸复合层。 |
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Ⅳ 制备凝胶及膜的夹层: |
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图2 Single gel membrane sandwich |
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图3 Tow gel membrane sandwich |
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Western转印的优化 |
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从SDS凝胶中进行Western蛋白转印的优化需要对一系列参数进行考虑。目的是转印所有凝胶上的蛋白并将其定量地转移到转印膜上。进行高效转印需要一定程度的优化,尤其是对于大分子量和小分子量蛋白。 |
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转印后,凝胶上应不残留或残留很少的蛋白。可以在转印后进行染色进行检测。转移出凝胶的蛋白应该仅在接触凝胶的膜的一面可见。如果有怀疑,在转印时使用第二个"支持膜",你可以在转膜后染色,以检查是否有穿膜的迹象。如果发现蛋白残留在凝胶上而且膜的结合性很差,可以考虑下列因素: |
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SDS vs 酒精 |
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在多数转印实验步骤中都使用SDS和酒精。但两者对于成功的转印有相反的作用,需要根据欲转印蛋白的性质加以优化。 |
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SDS对于蛋白的迁移是必要的,尤其有助于大分子量蛋白从凝胶上的转移。但由于膜结合需要疏水相互作用,SDS过多会抑制结合,尤其对于硝酸纤维素膜。如果从蛋白上剥离太多SDS,将无法将蛋白转移出膜。作为一个一般性的规则,如果膜的结合力有效,但蛋白仍旧残留在凝胶上,在转印缓冲液中加入0.01%会促进完全转印。建议的步骤在转印缓冲液中不含有SDS,但凝胶在电泳后不需要浸泡在转印缓冲液中;凝胶中残留的SDS对于有效的转印已经足够。但另一方面,酒精通过在蛋白上剥离SDS促进蛋白和膜的疏水接合。一般在转印缓冲液中加入20%的甲醇会增加硝酸纤维素膜的接合能力。 |
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凝胶浓度 |
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丙烯酰胺浓度越低,蛋白越容易转移下来。选择可以分离蛋白的浓度最低的凝胶。梯度胶适用于转印一系列不同大小的蛋白,因为凝胶的孔与不同大小的蛋白匹配良好。 |
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凝胶厚度 |
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蛋白比较易于从薄胶上转移下来,所以上样体积允许,使用1.0mm厚的胶取代1.5mm的胶。 |
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电场(电压×时间) |
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如果电压过低而且转印时间过短,部分蛋白会残留在凝胶上。如果电压过高,小蛋白会在结合到膜上前透膜而出。如果按建议的条件转印后有蛋白残留在胶上,增加电压可能会有帮助,但不要超过5V。但注意,一旦SDS从蛋白剥离,增加转印时间或提高电压就无效果。一旦结合,即使延长转印时间,大部分蛋白也会保持在膜上。 |
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膜的类型 |
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结合到硝酸纤维素膜上主要通过疏水键。硝酸纤维素膜对于常规使用非常好。对于小的多肽,建议使用小口径的膜。 |
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PVDF比硝酸纤维素膜更疏水,在转印过程中结合蛋白更紧密,可以耐受更多的SDS。目前,PVDF一般比硝酸纤维素膜需要更严谨的封闭条件。其适用于蛋白测序。 |
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尼龙膜通过疏水和静电相互作用结合。其SDS耐受度甚至高于PVDF,但也需要更严谨的封闭条件。主要建议用于Northern和Southern。 |
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