【转帖】iPad在手，轻松查看蛋白结构

记得在有一集《生活大爆炸》中，那些智商超高的科学怪才们又在捣鼓开发一款iPhone程序，想通过直接拍照来解微积分。不记得这款程序最终开发出来没有，但iPhone和iPad这些潮物在科学家中的普及肯定是毋庸置疑了。因此，也就涌现出一大批应用程序来帮助大家搞研究。下面就介绍两款蛋白方面的应用程序。

随着科学家逐渐解析出更多蛋白的结构，并将这些结构添加到数据库中，目前的蛋白结构数正在快速增长。过去，如果想要查看某个蛋白的结构，研究人员首先需要下载这个蛋白的结构数据组，然后将文件导入特殊的软件程序中。这个过程可不简单呢。

幸好，一些蛋白方面的应用程序被开发出来，让人们可以更轻松、更方便地随时随地查看蛋白质的结构。

iProtein
尽管乍一看，iProtein的主页平淡无奇，但是这只是假象，那些搞蛋白的肯定会被其内容所吸引。在其主页上有5块可点击的内容：序列、结构、家族、位点和结合配体。在序列和结构选项中，您可以输入一个关键词或PDB代码，页面上将会列出与之匹配的所有蛋白，以氨基酸或结构形式。在序列模式下，点击可下载的序列将启动序列搜索，来寻找相似的序列。在结构模式下，将会出现蛋白名称、分类、来源、参考文献和结构等。在家族选项中，您将了解到不同蛋白家族的成员。

结合配体这个选项可能会对药物学家有用。您可以在上面构建自己的分子，并提交，用于分析潜在的蛋白相互作用。如果您的配体能与蛋白结合，那么程序将会列出这一系列蛋白，以及PDB信息和配体结合的位点。如需查看配体以及蛋白的结构，iProtein将会链接到另一个iPad应用程序Molecules，我们下面将会介绍。

iProtein这款程序是由Eidogen-Sertanty, Inc.为iPad开发的，需要4.99美元，当然，有5天的免费试用，喜欢再买呗。

Molecules
这款程序是由Sunset Lake Software开发的，主要是用来查看蛋白质的三维结构。结构可向不同方向旋转，并随心所欲移动，通过手指滑动，还可轻松放大。速度快得惊人，某一特定氨基酸的放大和缩小似乎只是一瞬间。它还有一个功能，就是鉴定特定结构中关键的氨基酸残基，或只关注蛋白的某一部分。顺便提一句，它是免费的。

这个刚才丁香园的一个朋友推荐的生物研究类的网站，我看见了这篇 文章，感觉对所有有iPad的用户有好处，所以分享给大家。这篇文章转自慕薇雨，她的页面：http://163.fm/X6PFGZk