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【原创】WB 实验的心得(入门级)

丁香园

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Western blot 是现在实验技术中较常用但又不好控制的实验技术。近一月,一直在攻克这个高地,目前尚在努力中,有些心得想给大家聊聊。希望对大家的实验有点点帮助。

1)蛋白提取和定量:

A. 组织蛋白提取过程中,匀浆是一个多因素影响的过程,除了根据实验目的要加入各种蛋白酶抑制剂、磷酸酶抑制剂等之外,匀浆操作本身也有讲究。在其他条件都一致的情况下,匀浆操作尽量是一个人进行(手法一致,否则蛋白浓度和含量有差异)。

B. 所提取的蛋白,要注意分装、低温保存,或者 100 度加热制备成样品。

C. 蛋白定量,采用最简单的考马斯亮蓝就可以了,要特别精确的定量似乎没有必要。毕竟整个实验也只是半定量、看趋势的。

2)SDS-PAGE:

A. 制胶之后上样之前,最好要用电泳液将每个点样孔都冲洗干净(5ml 注射器就比较好用),否则条带有可能不规则。

B. 制胶时,严格按照分子克隆上介绍的方法和配方操作,PH 值也要调好,凝固太快或太慢都不行、不凝固也很麻烦,漏胶也很狼狈。这些都需要充足的准备工作。

C. 上样量按照蛋白浓度换算,大约每孔上 20-30ug 就行,多了条带也不行。

3)转膜:

A. 尽管有许多通用的方法出现在各种指南上、网站上,但还是需要结合自己的实验,进行适当的修正。

B. 遇大分子蛋白,转膜时间要延长;甲醇有利于蛋白与膜结合,但却缩小凝胶孔径而不利于转膜;SDS 有利于蛋白质从膜上转出,但不利于蛋白结合。

C. 转膜可在 4 度进行,过夜;也可在冰内进行,2-3h,但必须注意随时观察转膜槽周围的冰,看看是否有完整的冰块紧贴在槽壁上,如果不但没有贴上反而融化出一些大窟窿,就说明转膜温度太高,需要降低电压/电流,或者加强散热处理。温度高,必然影响转膜效果,严重时凝胶显著变形、碎裂,膜也皱索、移位等。

D. 通常 Tris-甘氨酸转膜 Buffer(pH8.3) 可以满足大多数蛋白质转膜的要求。但对于等电点等于或高于此的蛋白质,最好选用碱性更强的缓冲液转膜(例如 CAPS, pH11),否则转膜不完全,甚至转不上。

4)杂交:

A. 抗体的稀释度需要反复摸索;有时候问题就出在抗体上,而不是操作本身的问题。换抗体就出结果也是常有的。

B. 抗体回收应用问题,我们一般将首次使用后的抗体放 4 度冰箱,可以反复使用多次。我们的经验是,只要抗体液没有肉眼可见的沉淀,都还可以用。

C. 如果是用 ECL 检测信号,二抗的浓度一定要低,这样背景才干净。我们通常用 1:1万-1:5万的稀释度,不要怕浓度不够。

5)检测:

A. ECL 现在是比较看好的试剂,但价格还是比较贵,我们一般用 PIRECE 的。

B. ECL 在使用过程中时常有荧光淬灭的现象出现,不好避免。

C. ECL 试剂用量,我们 6cm × 8cm 大小的 PVDF 膜一般用 0.5-0.8ml (两种液混合后的总体积)就可以取得较好的效果。

D. 显影液和定影液也要在进行 ECL 试剂反应之前检查好、验证好(在暗室内首先看液体性状、配制时间,再用没有曝光的小胶片验证一下显影和定影效果),否则会在最后一步吃亏。

E. X 光片,选择 Kodak 的就比较好,没有必要用进口的,主要是不要让片子在检测之前就「有一定程度的曝光」,那样会导致最终的片子背景不干净。

一点粗浅的心得,还有待进一步修正。

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