microRNA芯片应用:筛选血清血浆中肿瘤早期诊断生物标志物
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microRNA是一类约22nt的小分子RNA,调控基因表达。目前有研究显示,microRNA能以沉默复合体的形式稳定存在于人类的血清血浆中。癌症患者由于细胞破损,会释放一部分癌症特异的microRNA进入循环系统中,这部分microRNA就能作为生物标志物进行肿瘤的早期诊断。
安捷伦是国际领先的生物芯片制造企业。它生产的microRNA芯片通过独特的探针设计能区分成熟miRNA和miRNA前体,同时具有特异性高、灵敏度高等特点。特别适用于血清血浆microRNA的检测。
Agilent microRNA芯片技术特点
1. 唯一能通过特殊的探针设计区分成熟miRNA和miRNA前体的芯片平台;
2. 无需分离miRNA,直接用Total RNA 进行实验,只需100ng的Total RNA 即可用来进行标记实验(不包括质检所消耗的量),避免了分离、富集、放大等过程带来的影响;
3. 样品适用范围广:组织、血清、血浆、FFPE、冰冻切片组织、脱落细胞等均可进行实验;
4. 高特异性:特殊的专利探针设计能区别一个碱基的差异;
5. 高灵敏度:检测丰度跨4个log,最高可达6个log,只要存在6000个拷贝的分子就可以检出;
6. 数据来源于Sanger 16.0/17.0版本,并方便及时更新。
Agilent microRNA芯片更胜一筹!
日本的科学家曾经对比过市面上主要的microRNA芯片平台(Agilent,Ambion,Exiqon,Invitrogen and Toray),结果发现Agilent的microRNA芯片具有很好的技术重复性,并且与金标准Taqman荧光定量PCR 的结果具有很好的一致性!
绝佳的技术重复性!
与Taqman荧光定量PCR结果具有很好的一致性
参考资料
Sato F, Tsuchiya S, Terasawa K, Tsujimoto G (2009) Intra-Platform Repeatability and Inter-Platform Comparability of MicroRNA Microarray Technology. PLoS ONE 4(5): e5540. doi: 10.1371/journal.pone.0005540
Sato F, Tsuchiya S, Terasawa K, Tsujimoto G (2009) Intra-Platform Repeatability and Inter-Platform Comparability of MicroRNA Microarray Technology. PLoS ONE 4(5): e5540. doi: 10.1371/journal.pone.0005540
血清血浆microRNA检测经典案例
一、筛选发现乙型肝癌血清血浆microRNA生物标志物
复旦大学中山医院肝癌研究所樊嘉教授课题组使用Agilent microRNA芯片对比肝癌患者VS正常人群,肝癌患者VS慢性乙型肝炎患者,肝癌患者VS肝硬化患者的血清血浆microRNA表达谱,共完成137个样品的microRNA芯片检测。筛选出15个明显差异表达的microRNA,并用RT-PCR的方法进行验证,最终建立了一个包含7个microRNA的多指标的logistic回归分析模型,用以区分肝癌患者和其它对照人群。这项研究成果对于肝癌的早期诊断和治疗有重大意义。相关microRNA芯片技术服务由上海伯豪生物技术有限公司完成。
原文:Plasma MicroRNA Panel to Diagnose Hepatitis B Virus–Related Hepatocellular Carcinoma. Journal of Clinical Oncology. November 21, 2011(影响因子18.97)
二、筛选发现血清血浆中的胃癌早期诊断标志物
生物芯片上海国家工程研究中心肖华胜博士课题组收集了7个胃癌患者、7个结肠癌患者和10个正常个体的血清样品,用Agilent公司的microRNA芯片进行microRNA表达谱分析,并对芯片结果进行RT-PCR验证。结果得到了7个在胃癌患者血清中高表达的microRNA。 随后用qRT-PCR的方法在另外收集的样品中对这7个microRNA进行进一步验证。发现miR-378在胃癌患者血清中特异性高表达。miR-378作为生物标志物的诊断价值较高,灵敏度达87.5%,特异性达70.73%。这一研究成果对于胃癌的早期诊断有重要意义。 相关microRNA芯片技术服务由上海伯豪生物技术有限公司完成。
原文:Genome-wide microRNA profiles identify miR-378 as a serum biomarker for early detection of gastric cancer. Cancer Letters. 2 November 2011(影响因子4.86)
上海伯豪生物技术有限公司(生物芯片上海国家工程研究中心)是Affymetrix在国内第一家认证的技术服务商,同时也是Agilent在国内唯一认证的技术服务商。为您提供稳定完善的Agilent microRNA芯片技术服务。