新型RNase抑制剂
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RNA 酶污染是全体从事 RNA 相关实验的人员的头号公敌。即使是100度高温或者是高压灭菌也不能完全灭活无孔不入的 RNases 。因而相关的实验中往往要用到RNA 酶抑制剂。
最常用的 RNA 酶抑制剂 Human Placental ribonuclease inhibitor ( HPRI )是一种蛋白质,可与多种 RNA 酶(包括 RNases A, B, C 类)非共价结合成为等摩尔复合物, 抑制RNA 酶活性。 HPRI 需要在 DTT 存在的条件下保持最大活性。包括 RNasin, SUPERase.in, RIP 等几个知名品牌的 RNA 酶抑制剂都属于这个类型。
Prime RNase Inhibitor 是一种全新的非人源的 RNase 抑制剂,和HPRI 一样,能够非共价结合并抑制 RNases A, B, C 类的 RNA 酶活性而不影响RNases T1, T2, H, U1, U2 和 CL3 的活性,因而不会干扰cDNA合成,SP6/ T7, Hela细胞提取物系统的RNA 体外转录,以及在兔网织红细胞裂解液或者是麦胚提取物中进行的体外翻译。
应用范围:
1.体外转录
2.体外翻译
3.第一和第二链cDNA合成
4.在非变性条件下纯化RNA 和mRNA ,
5.RT-PCR ,特别是单细胞 RNA 的 RT-PCR
6.RNA 结合蛋白的分 离
7.gel retardation assays
8.nuclear run-on transcription assays
9.polysome distribution analysis
优点:
比HPRI 更高效率的抑制 RNase 活性,一个单位的 Prime RNase Inhibitor 可以抑制5ng RNase 90 % 以上的活性,而同样情况下HPRI只能抑制50 % 的活性。
完全不需要加入DTT以维持最高活性。在更宽的pH值范围,更宽的 DTT 浓度范围和温度范围保持稳定
可用于非变性条件的 RNA 纯化过程,例如可用于带有 1%Nonidet 溶液的 RNA 抽提试剂,或者是单细胞 RNA 纯化和 RT-PCR
在变性条件下不会释放出已经结合的RNase。
实际上在没有DTT的条件下 Prime RNase Inhibitor 的活性更高,而在2 0mM DTT 下 Prime RNase Inhibitor 仍然有90 % 以上的活性。由于 Prime RNase Inhibitor 是一种蛋白质,所以应该保存于 -20 度,在 -70 度条件下会导致蛋白变性。
FAQ :
已经加入Prime RNase Inhibitor 后的 RNA 样品应该如何保存?
A :应该在 -20 度保存。
Prime RNase Inhibitor 成分是什么?是否 HPRI/ 或者 RNasin Ribonuclease Inhibitor 的另一版本?
A :是一种非人源蛋白。由于商业秘密不能透露。但是是完全不同类型的另一种蛋白。并非重组蛋白。
Prime RNase Inhibitor 是否适用于病毒 RNA 的 RT-PCR ?
A :当然适合
Prime RNase Inhibitor 是否适合于原来可以用 HPRI ( Human Placental RNase )的实验?
A : 实验表明 Prime RNase Inhibitor 适合于所有可以用 HPRI 的实验,而且效果更好。
Prime RNase Inhibitor 保存期有多长?应该如何保存?
A :正常情况下至少可保存 12 个月,应该在 -20 度保存而不能在 -70 度条件保存。
Prime RNase Inhibitor 并不能一直所有的 RNA 酶,它只对 RNase A , B , C 有显著的抑制效果,和 HPRI 一样的。
当抽提得到 RNA 后需要进行后继实验(例如蛋白质研究),什么时候加 Prime RNase Inhibitor 是最适合的?
A :在抽提 RNA 后应该将样品分装保存在 -80 度,当准备开始后继实验时,将 RNA 样品取出解冻完全后再加入 Prime RNase Inhibitor 。
Prime RNase Inhibitor 是否抑制 RNase H 活性?
A :不, Prime RNase Inhibitor 只抑制 RNase A B C 而不会抑制 RNase H (RNase H 专门降解 RNA 和 DNA 的杂交链中的 RNA 分子),因此有 Prime RNase Inhibitor 的存在不会影响 cDNA 合成反应,可以用于 cDNA 合成反应。
Prime RNase Inhibitor 是否需要加入 DTT 以激活抑制剂?
A :不需要,在没有 DTT 的条件下 Prime RNase Inhibitor 的抑制活性最高。
Prime RNase Inhibitor 是否可用于带有异硫氰酸胍的 RNA 抽提试剂?
A :不可以,由于 Prime RNase Inhibitor 是一种蛋白质,在这个条件下会变性。不过不同于 HPRI , Prime RNase Inhibitor 在这个条件下不会释放出原来已经抑制的 RNase 。
Prime RNase Inhibitor 是否可用于带有 1%Nonidet 溶液的 RNA 抽提试剂?
A :完全可以