蛋白质的分子量测定-SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳法
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实验原理 SDS是十二烷基硫酸钠(sodium dodecyl sulfate)的简称,它是一种阴离子表面活性剂,加入到电泳系统中能使蛋白质的氢键、疏水键打开,并结合到蛋白质分子上(在一定条件下,大多数蛋白质与SDS的结合比为1.4g SDS/1g蛋白质)。 使各种蛋白质-SDS复合物都带上相同密度的负电荷,其数量远远超过了蛋白质分子原有的电荷量,从而掩盖了不同种类蛋白质原有的电荷差别。这样就使电泳迁移率只取决于分子大小这一因素,于是根据标准蛋白质分子量的对数和迁移率所作的标准曲线,可求得未知物的分子量。 试剂和器材 一、试剂 30%分离胶贮存液:30g Acr,0.8g Bis, 用无离子水溶解后定容至100mL,不溶物过滤去除后置棕色瓶贮于冰箱。 10%浓缩胶贮存液:10g Acr,0.5g Bis, 用无离子水溶解后定容至100mL,不溶物过滤去除后置棕色瓶贮于冰箱。 分离胶缓冲液(Tris-HCl缓冲液 PH8.9):取1mol/L盐酸48mL,Tris 36.3g,用无离子水溶解后定容至100mL。 浓缩胶缓冲液(Tris-HCl缓冲液 PH6.7):取1mol/L盐酸48mL, Tris 5.98g,用无离子水溶解后定容至100mL。 电泳缓冲液(Tris-甘氨酸缓冲液PH8.3):称取Tris 6.0g, 甘氨酸28.8g, SDS 1.0g, 用无离子水溶解后定容至1L。 样品溶解液:取SDS 100mg,巯基乙醇0.1mL,甘油1mL,溴酚蓝2mg,0.2mol/L,pH7.2磷酸缓冲液0.5mL,加重蒸水至10mL(遇液体样品浓度增加一倍配制)。用来溶解标准蛋白质及待测固体 染色液:0.25g考马斯亮蓝R-250,加入454mL 50%甲醇溶液和46mL冰乙酸即可。 脱色液:75mL冰乙酸,875mL水与50mL甲醇混匀。 10%过硫酸铵溶液;10%SDS溶液;1%TEMED。 二、材料 标准蛋白:溶菌酶(Mr 14 300)、胰凝乳蛋白酶原(Mr 25 000)、胃蛋白酶(Mr 35 000)、卵清蛋白(Mr 43 000)、血清白蛋白(Mr 67 000)等。按每种蛋白0.5-1mg/mL配制。可配成单一蛋白质标准液,也可配成混合蛋白质标准液。 二、器材 DYCZ-24D型垂直板电泳槽;移液管1 mL(′ 3),5 mL(′ 4),0.5mL(′ 1),0.1mL(′ 2);烧杯100mL(′ 2);细长头的吸管;微量注射器。 操作方法 一、 安装垂直板电泳槽 1. 将密封用硅胶框放在平玻璃上,然后将凹型玻璃与平玻璃重叠; 2.用手将两块玻璃板夹住放入电泳槽内,玻璃室凹面朝外,插入斜插板; 3.用蒸馏水试验封口处是否漏水。 二、 制备凝胶板 1.分离胶制备:取分离胶贮存液 5.0mL, Tris-HCl缓冲液(PH8.9)2.5mL,10%SDS 0.20mL, 去离子水10.20mL, 1%TEMED2.00mL置于小烧杯中混匀,再加入10% 0.1mL过硫酸胺,用磁力搅拌器充分混匀2min。混合后的凝胶溶液,用细长头的吸管加至长、短玻璃板间的窄缝内,加胶高度距样品模板梳齿下缘约1cm。 用吸管在凝胶表面沿短玻璃板边缘轻轻加一层重蒸馏水(约3-4cm),用于隔绝空气,使胶面平整。分离胶凝固后,可看到水与凝固的胶面有折射率不同的界限。倒掉重蒸水,用滤纸吸去多余的水。 浓缩胶制备:取浓缩胶贮存液3.0mL, Tris-HCl 缓冲液(PH6.7)1.25mL,1%TEMED2.00mL, 4.60mL去离子水,10% 过硫酸胺0.05mL,用磁力搅拌器充分混匀。混合均匀后用细长头的吸管将凝胶溶液加到长短玻璃板的窄缝内(及分离胶上方),距短玻璃板上缘0.5cm处,轻轻加入样品槽模板。 待浓缩胶凝固后,轻轻取出样品模槽板,用手夹住两块玻璃板,上提斜插板,使其松开,然后取下玻璃胶室去掉密封用胶框,用1%电泳缓冲液琼脂胶密封底部,再将玻璃胶室凹面朝里置入电泳槽。插入斜插板,将电泳缓冲液加至内槽玻璃凹口以上,外槽缓冲液加到距平玻璃上沿3mm处。 三 、样品处理 各标准蛋白及待测蛋白都用样品溶解液溶解,使浓度为0.5mg/mL,沸水浴加热3分钟,冷却至室温备用。处理好的样品液如经长期存放,使用前应在沸水浴中加热1分钟,以消除亚稳态聚合。 四、加样 一般加样体积为10-15μL(即2-10μg蛋白质)。如样品较稀,可增加加样体积。用微量注射器小心将样品通过缓冲液加到凝胶凹形样品槽底部,待所有凹形样品槽内都加了样品,即可开始电泳。 五、电泳 将直流稳压电泳仪开关打开,开始时将电流调至10mA。待样品进入分离较时,将电流调至20-30 mA。当蓝色染料迁移至底部时,将电流调回到零,关闭电源。拔掉固定板,取出玻璃板,用刀片轻轻将一块玻璃撬开移去,在胶板一端切除一角作为标记,将胶板移至大培养皿中染色。 六、染色及脱色 将染色液倒入培养皿中,染色1h左右,用蒸馏水漂洗数次,再用脱色液脱色,直到蛋白区带清晰,即可计算相对迁移率。 七、结果处理 测量由点样孔至溴酚蓝及蛋白质带的距离(mm),计算相对迁移率(Rf) Rf =样品移动距离(mm)/溴酚蓝移动距离(mm) 以标准蛋白分子量的对数作纵坐标,相对迁移率作横坐标制作标准曲线。根据样品蛋白质的相对迁移率从标准曲线上查出其分子量。 注意事项 (1)用SDS-凝胶电泳法测定分子量时,每次测量样品必须同时作标准曲线,而不得利用另一次电泳的标准曲线。 (2)因SDS可吸附考马斯亮蓝染料,染色前先用脱色液浸泡凝胶,洗去SDS。可使染色及脱色时间缩短,并使蛋白带染色而背景不染色。
思考题 1.用SDS-凝胶电泳法测定蛋白质分子量时为什么要用巯基乙醇? 2.是否所有的蛋白质都能用SDS-凝胶电泳法测定其分子量?为什么? |