ibidi:超详细的实验图像自动化分析方法
臻和
德国易必迪 ibidi 公司专注于细胞培养及功能实验的耗材及仪器开发,目前已研制出一系列广受好评的细胞功能实验的相关产品,例如研究细胞迁移的 culture-insert 产品、研究细胞侵袭的 ibipore、研究血管生成以及细胞趋化系列产品等。
我们知道在这些功能研究中,除了做好实验部分,数据分析也是很非常重要的一个环节。图像处理往往会消耗工作人员大量精力,而且容易带入人为主观性,导致所得结果的准确性和可重复性稍差。
ibidi 公司与 Wimasis 合作开发了一系列相关的自动化分析软件,可以帮助科研工作者从图片中获得更多的定量数据,并节约大量时间。
WimScratch——伤口愈合图像分析
WimScratch 伤口愈合图像分析软件能在几分钟内对 2D 的细胞迁移和伤口愈合实验做成像分析和数据处理。无需任何额外的软件和硬件,只需将图片上传到数据分析平台。通常情况下,几个小时之内即可获得分析结果。
利用 ibidi culture insert 产品做伤口愈合实验,从样品制备到获得统计结果,只需要四步:铺细胞,产生划痕——获得显微镜成像结果——上传图片、图像处理——获得统计结果。
与手动划痕及手动软件分析方法相比较,culture insert 产品可以产生边缘整齐的 500μm 的无细胞间隙,无需进行划痕区域宽度的校正;WimScratch 分析软件可以帮助您在短时间内获得可靠的多种定量分析结果。
分析数据包括:
a) 细胞覆盖面积
b) 终止速度(平均≥5 个图像)
c) 加速特征(平均≥5 个图像)
d) 概览图
e) 中间接合处的近似值(平均≥5 个图像)
产品特点:
1. 全面解决伤口愈合实验-从样品准备到成像分析只需要几步2. 客观的和可再生分析
3. 简单并且快速的数据处理-几分钟出结果
4. 不需要额外的硬件或者软件
应用:
1.伤口愈合和细胞迁移实验结果定量化;
2.细胞迁移实验成像分析和数据处理。
WimTube——血管生成图像分析
同 WimScratch 伤口愈合图像分析软件一样,WimTube 血管生成图像分析软件是一款基于网站的自动化分析平台。您无需任何额外的硬件及软件,只要将您血管生成的图像上传,软件自动分析。通常几个小时内,几个小时之内即可获得分析结果。
血管形成图像分析是血管生成实验中的一个关键步骤。通过 ImageJ 或者 Fiji 等软件进行手动分析,通常耗费时间,而且容易带入人为主观因素,导致所得实验结果的可靠性和可重复性不尽人意。
WimTube 软件可以自动化分析成环数量、分叉点数量等,并且在图片上通过颜色 、点等特征进行标注,分析结果易于理解、可靠、可重复。
数据分析结果包括:
1. 小管长度,数量和平均值
2. 细胞覆盖面积
3. 环状结构的数量,区域和周长
4. 分叉点的数量
产品特点:
1. 全面解决血管生成实验-从样品准备到成像分析仅需几步;2. 客观性和可重复性实验分析;
3. 简单快速的数据处理-几分钟出结果;
4. 不需要额外的硬件和软件。
应用:
1. 定量化分析血管生成实验;
2. 血管生成实验成像分析和数据处理;
3. 研究血管生成抑制。
WimSprout——出芽实验图像分析
出芽实验是血管新生研究中另一种非常常用的研究手段。WimSprout 图像分析软件应用于血管生成研究及肿瘤生长的出芽实验图像分析。同样,您只需要上传实验图像,几个小时后,通过邮件,您即可获得出芽实验的分析结果。
产品特点:
1. 全面解决血管生成实验中的出芽研究-从样品准备到成像分析仅需几步;
2. 客观性和可重复性实验分析;
3. 简单快速的数据处理-几分钟出结果;
4. 不需要额外的硬件和软件;
5. 可应用于:出芽球体实验、动脉环实验、纤连蛋白凝胶珠实验。
应用:
1. 定量化分析出芽实验;
2. 动脉环实验成像分析和数据处理;
3. 研究出芽增强或者抑制;
4. 纤连蛋白凝胶珠实验。
WimTaxis——细胞趋化图像分析
同样是一款基于网页的定量成像分析软件,可在相差显微镜中自动跟踪非标记细胞趋化性试验。您只需上传数据到图像分析平台,几个小时之内即可获得分析结果。
WimTaxis 在趋化实验中可以准确检测视频中的细胞和细菌。通过追踪细胞及细菌的运动进而提供他们的运动轨迹。根据您的分析对象,选择 WimTaxis-Cell 或者 WimTaxis-bacteria 模式,就可以快速、可靠的获得您的分析结果。
数据分析结果包括:
1. 细胞追踪定位动画显示;
2. 迁移效率(水平和垂直方向);
3. 细胞追踪轨迹视频;
4. 踪迹和质心统计。
产品特点:
1. 全面解决细胞趋化性实验-从样品准备到成像分析仅需几步;2. 客观性和可重复性实验分析;
3. 简单快速的数据处理-几分钟出结果;
4. 不需要额外的硬件和软件;
5. 两种模式可选:细胞追踪和细菌追踪。
应用:
1.2D 细胞趋化性实验定量分析;
2. 细菌趋化性实验定量分析;
3. 细胞趋化性和迁移实验成像分析和数据处理。