全世界科研工作者都在用的网站，堪称生物网站中的超级航母！

UCSC 是一个非常庞大的类似于 NCBI 的航母式网站，里面包含了非常多的信息，也有很多非常好用的小工具。

简单介绍

网址：https://genome-asia.ucsc.edu/index.html

UCSC 是生物领域里常用的数据库之一，由 University of California Santa Cruz (UCSC) 创立和维护，主要包含了人类、小鼠、果蝇等多种常见物种的基因组信息。

UCSC 里也包括了一系列的分析工具，帮助用户浏览基因信息、查看已有基因组注释信息和下载基因序列等，用户可以通过它可靠和迅速地浏览基因组的任何一部分，并且同时可以得到与该部分有关的基因组注释信息，如已知基因，预测基因，表达序列标签，信使 RNA，CpG 岛，克隆组装间隙和重叠，染色体带型，小鼠同源性。

一、查找某基因的具体序列信息

1. 浏览器打开 UCSC 官网，鼠标放置于 Genome 位置，若想查询人类基因则点 Human GRCh38 /hg38，若想查询小鼠基因则点击 Mouse GRCm38 /mm10。

在此我们以查询人类基因中的 lncRNA CASC15 为例进行介绍。

2. 点击 Human GRCh38 /hg38 进入查询页面。

当输入基因名称的专一性不是很强的时候会出现如下左图所示界面；然后在如图所列的基因中选择需要查询的基因点击进入，同样会进入如下左图所示界面。

当输入基因名称的专一性很强的时候会出现如下右图所示界面（专一性强的名称是指网站自动推荐的名称，如下图红色框内所示）

3. 目的基因的可视化显示，如下图所示。

点击任意一个转录本，进入下一界面（要看具体研究的是哪个转录本）

4. 目的基因具体序列信息查询。

5. 目的基因具体序列信息查询时的参数设置。

6. 目的基因具体序列信息查询结果。

二、目的基因的基因组定位及邻近基因查询

1. 按照第一个功能的方法在搜索框内输入目的基因（以 CASC15 为例）点击 go，进入下一界面。

2. 查询结果。

三、目的基因表达丰度查询

1. 按照第一个功能的方法在搜索框内输入目的基因（以 CASC15 为例）点击 go, 进入下一界面。

2. 查询结果-可视化

3. 查询结果-量化

鼠标下拉后还能看到其他类型的量化结果，如下图所示。

四、目的基因的保守性查询

1. 按照第一个功能的方法在搜索框内输入目的基因（以 CASC15 为例）点击 go, 进入下一界面。

2. 查询结果-可视化。

3. 同源性查询结果。

五、其他功能

1. 目的基因位置附近存在 SNP 位点。

2. BLAT 功能

BLAT 功能就是查询某段碱基序列在基因组中的定位，将其匹配到基因组中。

3. 外显子引物设计