如何预测 CpG 岛？

CpG 作为作为表观调控的重要组成部分，在基因调控方面起着重要作用。CpG 岛是什么，CpG 岛主要位于基因的启动子（promotor）和第一外显子区域，约有 60% 以上基因的启动子含有 CpG 岛。CpG 岛的 GC 含量大于 50%，长度超过 200bp。

接下来介绍几个网站：EMBOSS、MethPrimer、Sequence Manipulation Suite。这三个网站的网址在对话框回复【0521】即可查询复制。

这三个网站操作起来大同小异，EMBOSS 刚进入界面

点击红色方框的 LaunchCpgplot

在方框内随意输入一个基因的启动子序列，接着点击红色方框的 submit

这即为图片结果，点击红色方框，得到文字结果

在 MethPrimer 网站也一样，进入网站界面

点击红色方框进入

在方框里输入启动子序列，直接就 submit 即可，输出结果

同理在 SequenceManipulation Suite 网站上，进入界面，直接输入启动子序列，如下图

点击 submit

这三个网站得出的结果相似，只是表现形式不一样而已，预测 CpG 岛就这么简单，但是元元有话说，CpG 岛预测只是作为参考，最终 CpG 岛是否发挥功能依旧需要细胞学实验验证，例如用甲基转移酶抑制剂 5aza 进行验证，最主要的是需要通过测序手段来说明 CpG 岛甲基化情况。如果不存在

甲基化，即使存在 n 种甲基化位点，那也没用。