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NCBI设计PCR引物图文详解,看了就会

丁香园

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首先打开NCBI主页,大E浏览器有时候打不开,可以换个浏览器试试

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/

然后按照以下步骤进行就可以了



打开主页后,选择Gene,然后在后面输入目的基因名,基因后面可以加空格然后加种属缩写,不知道种属缩写也可以不加

点击Search

找到目的基因,注意后面标记的种属,然后点基因名

进入下一页面后,向下拉,直到mRNA and Protein,点击红色数字

向下拉

复制序列,然后另打开NCBI主页,点右侧第五个Blast

向下翻到specialized blast,点第二行 Primer-Blast ↓

注意为FASTA sequence,因此在第一行键入>ACTB(ACTB为目的基因名),然后回车,粘贴刚刚复制的序列

将上图product size数字改成下图数字

继续

下拉菜单如上图选择

上图intron inclusion后的勾勾,但如果勾选上得不到结果,就可以不选。以上两步都是为了防止DNA污染。

其它都可以不改,然后点Get Primers

需要运行几十秒,得到10对引物后进行选择,最好GC百分比在45%-55%之间,Tm在60℃左右。

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