还不会用 NCBI 设计 PCR 引物吗?
丁香实验
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首先打开 NCBI 主页,大 E 浏览器有时候打不开,可以换个浏览器试试。
然后按照以下步骤进行就可以了。
打开主页后,选择 Gene,然后在后面输入目的基因名,基因后面可以加空格然后加种属缩写,不知道种属缩写也可以不加。
点击 Search。
找到目的基因,注意后面标记的种属,然后点基因名。
进入下一页面后,向下拉,直到 mRNA and Protein,点击红色数字。
向下拉。
复制序列,然后另打开 NCBI 主页,点右侧第五个 Blast。
向下翻到 specialized blast,点第二行 Primer-Blast ↓
注意为FASTA sequence,因此在第一行键入 >ACTB(ACTB 为目的基因名),然后回车,粘贴刚刚复制的序列。
将上图 product size 数字改成下图数字
继续。
下拉菜单如上图选择
上图 intron inclusion 后的勾勾,但如果勾选上得不到结果,就可以不选。以上两步都是为了防止 DNA 污染。
其它都可以不改,然后点 Get Primers。
需要运行几十秒,得到 10 对引物后进行选择,最好 GC 百分比在 45%-55% 之间,Tm 在 60℃ 左右。