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如何研究某基因表达的调控?

生物学霸

5974

2015 年,研究 RNA 及 RNA 结合蛋白的最新颖最热门的生物技术当属于 ChIRP-MS 和 RAP-MS,McHugh 和 Chu 等人分别运用该技术成功的在活体细胞内研究了 Xist 基因及其结合蛋白的相互作用。

自二十世纪五六十年代中心法则被提出以后, 遗传信息的传递从 DNA 转录为 RNA, 再由 RNA 翻译为蛋白质就成为分子生物学领域的黄金法则。它表明遗传信息在不同大分子之间的传递都是单向的,不可逆的。

在以后的研究中,发现有些病毒 RNA 的自我复制及反转录为 DNA,虽然对中心法则进行了补充,但并没有撼动其黄金地位。看似如此简单的中心法则被赋予黄金地位,岂不是名不副实,科学家怎能就此罢手。近年来,研究清楚围绕这个黄金定律华丽多变的装束便成了科学工作者为之奋斗的目标。

遗传信息从 DNA 转录为 RNA 的过程在细胞内得到调控是必不可少的底妆,它包括 DNA 甲基化、组蛋白修饰、转录因子、启动子、增强子等;而从 RNA 翻译为蛋白质的淡妆登场过程,也起到了如此重要的作用。

包括 RNA 的可变剪接和 miRNA、lncRNA、circRNA 等调节 RNA;清纯美丽的蛋白质初现其形时总少了点魅力,需要通过翻译后修饰才可整装待发,包括蛋白质的磷酸化、乙酰化等修饰。如此一番精心打扮,中心法则便无可挑剔的完成了女神一样的蜕变。

工欲善其事必先利其器,在这个蜕变的过程中,多种研究方法起到了至关重要的作用,例如转录水平的 ChIP、EMSA、Luciferase reporter assay、DNase footprint、DNA pull-down、Reverse-ChIP;甲基化检测的 MeDIP-Seq、BSP、MSP、HRM 等;转录后水平的 RNA pull down、RAP、TRAP、ChIRP 等。

他们各有千秋,在女神华丽转身的背后都功不可没。

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