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5.31 价值数十亿美元!人工智能已渗透入蛋白质组学

柚子酱

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周五啦!开不开心!


①价值数十亿美元!人工智能已渗透入蛋白质组学

慕尼黑工业大学(TUM)的研究人员利用人工智能,成功地使任何有机体的蛋白质质量分析比以前快多了,而且几乎没有错误。这种新方法将引起蛋白质组学领域的巨大飞跃,因为它既可以应用于基础研究,也可以用于临床研究。

原文检索:Prosit: proteome-wide prediction of peptide tandem mass spectra by deep learning


②首次证明“骨关节炎”和“类风湿性关节炎”确定来源于不同类型的致病细胞

牛津大学和伯明翰大学的科学家5月29日在《Nature》杂志上发表了一项开创性的研究,使我们距离开发针对炎症疾病的靶向治疗方法更进了一步。

研究小组首次表明,不同类型的成纤维细胞——动物中最常见的结缔组织细胞——在关节中被组织成不同的层次,并导致两种截然不同的关节炎:骨关节炎(osteoarthritis)和类风湿性关节炎(rheumatoid arthritis)。

原文检索:Distinct fibroblast subsets drive inflammation and damage in arthritis


③Cell:镁通量调节核糖体来增加细菌的生存

加州大学圣地亚哥分校等处的研究人员通过研究枯草芽孢杆菌的膜电位动力学中细胞间的变异来预测细菌的存活,发现在接触抗生素之后,细菌对压力的耐受性会表现出细胞间的变异,有较高恢复力的“休眠”(非生长细胞状态)的细胞中的镁通量可以增强对核糖体靶向抗生素的抵抗力。

参考:[1] Magnesium Flux Modulates Ribosomes to Increase Bacterial Survival. (《Cell》Volume 177, Issue 2, 4 April 2019, Pages 352-360.e13)


④KRAS突变虽然被抑制,可细胞还有备胎啊

加州大学旧金山分校的研究人员近日利用CRISPR干扰(CRISPRi)功能基因组学平台系统鉴定了KARS G12C抑制剂与靶点的遗传相互作用,并发现了可增强抑制剂功效的组合疗法,有望防止耐药性的出现。

原文检索:KRASG12C inhibition produces a driver-limited state revealing collateral dependencies


⑤暨南大学吴宝剑研究组Hepatology发现生物钟基因在氨基酸代谢中的关键作用

氨基酸代谢稳态对人类的健康至关重要,来自暨南大学药学院的吴宝剑教授研究组发表了题为“REV‐ERBα antagonism promotes homocysteine catabolism and ammonia clearance”的文章,发现生物钟基因REV-ERBα在氨基酸代谢的昼夜节律调节中扮演了重要角色,其拮抗作用可以缓解高同型半胱氨酸血症并促进氨清除,从而有助于科学家们寻找一种管理同型半胱氨酸和氨相关疾病的新方法。

这一研究发现公布在4月份的Hepatology杂志上,由暨南大学药学院的吴宝剑教授领导完成。

原文检索:REV‐ERBα antagonism promotes homocysteine catabolism and ammonia clearance


⑥破解“化骨绵掌”幕后黑手——叛变的脂肪细胞

一项对多发性骨髓瘤(multiple myeloma,MM)患者样本的研究已经证明了“重新编程”的脂肪细胞,即使在癌症已经得到缓解后,是如何导致长期的骨损伤的。

以分子复合物作为靶标可减轻小鼠体内骨损害病变的严重程度,提示针对MM这种常见的且使人虚弱的并发症的可能治疗对策。

原文检索:Reprogrammed marrow adipocytes contribute to myeloma-induced bone disease,Science Translational Medicine


关键词:实验专区

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