与猪基因组序列相关的文章
今天,猪基因组测序协会和五指山小型猪的基因组测序在GigaScience上发表了《自然环境下的家猪基因组序列》。伴随这些出版物的是生物医学中心跨期刊系列文章的一堆配套文章。
杜玉涛、冯树堂和同事们在《超级科学》杂志上描述了五指山小型猪的独立基因组测序。该品种是人类医学应用的一个新兴模型,其测序提供了有关冠状动脉疾病相关基因与人类和猪的药物靶点之间遗传相似性和差异性的重要信息。他们还发现,与其他猪品种不同,该品种已经丢失了一种整合到基因组中的病毒,增加了猪和人类之间进行异种移植的可能性。
杜洛克猪(左)和五指山猪(右):这两个测序项目的受试者。来源:Duroc改编自David Merrett在Flickr上发布的图片,Creative Commons 2.0
医学模型
本系列的几篇文章探讨了基因组序列在生物医学方面的重要性。Eric Walters和他的同事回顾了猪作为大型动物生物医学模型的作用,以及猪的基因组序列如何提高了我们的理解。他们解释说,猪是一种很好的心血管疾病模型,也是唯一能准确概括囊性纤维化症状的动物。
汤姆弗里曼和同事描述了第一个详细的基因表达图谱的家猪。这为哺乳动物组织生理学研究提供了重要的新资源。他们通过对胃肠道的详细观察证实了这一点,并强调了几种可能导致胃肠道疾病的候选基因。本系列的其他文章调查了猪基因组中的促激素和转化酶基因、嗅觉基因库和-防御素基因。
肉的发现
其他文章关注的是基因组序列与将猪理解为食用动物的相关性。帕梅拉·维纳、罗伯·奥格登和同事们描述了一种能够区分英国传统猪品种的新的基因诊断方法。作者解释说,标签错误在食品行业很普遍,但他们的分析可以成功地将猪肉产品与不同的传统品种区分开来,这些传统品种的猪肉价格往往高于商业品种。
最后,一些进一步的文章探讨了猪基因组的结构及其序列的组装和注释。在一篇文章中,Martien Groenen和同事绘制了整个基因组的重组图,发现了性别特异性重组率和与GC含量的相关性。Bertrand Servin和他的同事描述了在基因组组装中使用的辐射混合图谱。
猪间期染色体在胚胎和成年成纤维细胞、间充质干细胞和淋巴细胞细胞核内的区域图像。