合作专家 | 徐颖博士
结构生物学 中国科学技术大学
审核专家 | 于涛博士
生物化学分子生物 中国科学院大学
简介
利用独特包埋的磁珠吸附 DNA,随后在特定溶液下洗脱从而达到分离纯化 DNA 的目的。
原理
独特包埋的磁珠,在一定条件下对核酸具有很强的亲和力,当用特定洗脱溶液洗涤时,其会释放吸附的 DNA,从而达到快速分离纯化核酸的目的。
用途
从组织、细胞或血液中快速提取 DNA;以及提取质粒 DNA。
材料与仪器
器材:磁力架、移液枪、微量离心机、涡旋仪、金属浴或水浴锅;
试剂:裂解液、磁珠、异丙醇、蛋白酶混合液、洗涤液 A、洗涤液 B、洗脱液、胰蛋白酶;
耗材:移液器枪头、离心管、组织或细胞、细胞刮、培养皿。
步骤
1. 样本处理:
组织样品:取新鲜或冷冻样本 40 mg,加入 400 μl 裂解液,研磨匀浆后,10 000 g 高速离心 5 min,取上清;将上清转移至新的离心管中,并加入 20 μl 蛋白酶混合液,涡旋振荡 10 sec,56 ℃ 孵育 10 min。
细胞样品:悬浮培养的细胞直接通过 500 g 离心 5 min 获取细胞沉淀;贴壁培养的细胞用 0.5% 胰蛋白酶消化或用细胞刮从培养皿中将细胞刮下,而后 500 g 离心 5 min 得细胞沉淀。在约含 5 × 106 个细胞的沉淀中依次加入 400 μl 裂解液和 20 μl 蛋白酶混合液,涡旋振荡 10 sec, 56 ℃ 孵育 10~30 min。
2. 将消化完毕的样本取出,置于离心管架上冷却到室温。另取一个空的离心管,加入 400 μl 裂解液和 20 μl 蛋白酶混合液作为阴性对照(可选)。每个管中依次加入 300 μl 异丙醇和 25 μl 磁珠,盖上管盖,上下颠倒离心管 5 次以混合均匀,涡旋振荡 1 min。
3. 然后静置 5~10 min,静置完毕涡旋振荡 30 sec,使磁珠均匀分布,与样品充分接触。重复此步骤一次。而后 12 000 g 离心 1 min,离心完毕将离心管置于磁力架上,静置 2 min,弃上清。
4. 加入 500~700 μl 洗涤液 A,涡旋振荡 10 sec,直至管内磁珠分布均匀。12 000 g 离心 15 sec,离心完毕将离心管置于磁力架上,静置 2 min,弃上清。
5. 重复步骤 4 两次。
6. 加入 500~700 μl 洗涤液 B,涡旋振荡 10 sec,直至管内磁珠分布均匀。12 000 g 离心 15 sec,离心完毕将离心管置于磁力架上,静置 2 min,弃上清。
7. 重复步骤 6 两到三次。
8.12 000 g 空离 30 sec,并用移液器小心地将管内残余液体吸出,打开管盖,室温干燥 2~5 min。
9. 每管加入 100 μl 洗脱液,用移液器吹吸磁珠-洗脱液混合物,以使磁珠均匀分布。65 ℃ 孵育 3~10 min。
10. 12 000 g 离心 15 sec,离心完毕将离心管置于磁力架上,静置 2 min 或直至液体变澄清。
将含有 DNA 的洗脱液转移至新的离心管中。24 hrs 内使用可储存在 2 ℃~8 ℃ 冰箱,长时间储存应置于 -20 ℃ 冰箱保存。
注意事项
1. 磁珠较为昂贵,可以重复使用,切勿用过即扔。
2. 步骤 8 中,干燥时间最长不超过 5 min,磁珠表面失去光华即可,避免干燥过度,磁珠不易重悬。
常见问题
干燥过度,磁珠成团,不易重悬。
来源:丁香实验