合作专家 | 刘欢硕士
生物化学分子生物 中国农业科学院
审核专家 | 陈慕华博士
肿瘤学 北京大学
简介
用离心柱法来提取 DNA,得到的 DNA 质量好,纯度和浓度较高。
原理
离心柱上有硅胶滤膜,在高盐低 pH 条件下,核酸能结合到硅胶膜上,而蛋白质和其他代谢产物被洗脱;后续改变反应条件到低盐高 pH 来洗脱纯化 DNA。
用途
用于 DNA 的提取。
材料与仪器
需要提取 DNA 的样本(血液/细胞/组织 DNA),蛋白酶 K,天根 DNA 提取试剂盒(货号:DP304),无水乙醇、离心机等。
步骤
1、平衡液预处理
取一个新的吸附柱放在收集管中,悬空加入 100 μL 的平衡液至离心柱中,12 000 rpm 离心 1 min,倒掉收集管中的废液,将离心柱放回收集管中,备用。
2、处理材料
(1)如提取材料为血液,可直接使用 200 μL 新鲜、冷冻或加入各种抗凝剂的血液,不足 200 μL 可加缓冲液 1 补足;
(2)贴壁培养的细胞和动物组织应先处理为细胞悬液,然后 10 000 rpm 离心 1 min,弃上清,加 200 μL 缓冲液,振荡至彻底悬浮;
3、加入蛋白酶 K,混匀
(1)提取血液和细胞基因组时,只需加入蛋白酶 K 混匀,即可继续进行下一步;
(2)提取组织基因组时,加入蛋白酶 K 混匀,需在 56 ℃ 放置,直至组织溶解,12 000 rpm 离心 30 s 以去除管盖内壁的水珠,再进行下一步骤。
4、加入 200 μL 缓冲液 2,充分颠倒混匀,70 ℃ 放置 10 min,溶液应变清亮,12 000 rpm 离心 30 s 以去除管盖内壁的水珠。
5、加入 200 μL 无水乙醇,充分振荡混匀 15 s,此时可能会出现絮状沉淀,12 000 rpm 离心 30s 以去除管盖内壁的水珠。
6、将上一步所得溶液和絮状沉淀都加入一个吸附柱中(吸附柱放入收集管中),12 000 rpm 离心 30 s,倒掉废液,将吸附柱放回收集管中。
7、向吸附柱中加入 500 μL 缓冲液 3(注意:使用前请确保已加入无水乙醇!), 12 000 rpm 离心 30 s,倒掉废液,将吸附柱放入收集管中。
8、向吸附柱中加入 600 μL 漂洗液(注意:使用前请确保已加入无水乙醇!),离心 30 s,倒掉废液,将吸附柱放入收集管中。
9、重复操作步骤 8。
10、将吸附柱放回收集管中,12 000 rpm 离心 2 min,尽量去除漂洗液,将吸附柱置于室温放置数分钟,以彻底晾干吸附材料中残余的漂洗液。
11、将吸附柱转入一个干净的离心管中,向吸附膜的中间部位加 50~100 μL 洗脱液,室温放置 3~5 min, 12 000 rpm 离心 2 min;将得到的溶液重新放回吸附柱中,室温放置 2 分钟,12 000 rpm 离心 2 min,收集 DNA 溶液。
12、DNA 可以存放在 2~8 ℃,若要长时间存放,可以放置在 -20 ℃。
注意事项
1、所有的离心步骤均在室温完成,均使用台式离心机;
2、使用前确保缓冲液 3 和漂洗液中预先加入无水乙醇;
3、实验前将需要的水浴先预热到 70 ℃ 备用;
4、第 10 步,要让漂洗液挥发干净,否则会影响后续的实验;
5、样品需要避免反复冻融,否则会影响 DNA 的得率。
常见问题
1、最终没得到 DNA,可能是缓冲液 3 和漂洗液中没有加入无水乙醇;
2、DNA 得率低,可能是样本不新鲜或者样本经过反复冻融。
来源:丁香实验