原理
人 TATA 结合蛋白(TBP)能够结合不同类型的细胞内蛋白以形成不同的蛋白复合体,如 SL1、TFIID 和 TFIIIB。这些蛋白质分别是通过 RNA 聚合酶 I、II 和 III 的转录所必要的。所有这些不同的蛋白复合体在核抽提物中都能找到。用一个层析步骤,如 P11 离子交换柱,把含 TBP 的不同的复合体分离成为不同组分,然后进行免疫亲和纯化。
材料与仪器
各种 BC 缓冲液(BC100、BC300、BC500、BC850 和 BC1200)
层析柱(容积约 100 ml) 流体适配器图表记录器样品收集器 透析管(MWCO 12000)
步骤
1. 用逆转录病毒介导的转基因建立一个 HeLa 细胞衍生的表达 FLAG 标记的人 TBP 的细胞系,并且按照基本方案 1 步骤 1~24,从建立的细胞系中制备核抽提物、S100 和核团块。
2. 在一个层析柱中装一个约含 60 ml 树脂的 P11 离子交换柱。
3. 将柱连到一个流体适配器、图表记录器和样品收集器上,用 BC100 平衡整个系统过夜。流速设置为每小时约 1 个柱体积(CV),即 1 ml/min。
4. 4℃ 时在一个冰桶中融化约 100 ml 核抽提物过夜。
5. 4℃ 时将核抽提物 105000 g 离心 20 min。
6. 上清倒入 50 ml 试管以 1 CV/h 的流速上样至已平衡的 P11 柱。用样品收集器收集洗出物,约 12 ml 每管。
记住保留一小份(约 100μl)进行免疫印迹分析。
7. 用约 2 CV 的 BC100 洗涤柱子直到在 280 nm 的吸收值几乎达到基线。
8. 当每种洗脱缓冲液的蛋白质曲线几乎接近基线时,相继转换到 BC300、BC500、BC850 和 BC1200 进一步洗脱结合蛋白。
9. 混合对应 BC100、BC300、BC500 和 BC850 蛋白峰的组分。
10. 将 BC500 和 BC850 样品在 4L BC100 中 4℃ 透析 5 h。
11. 将样品 46000 g 4℃ 离心 15 min。
12. 将 BC500 和 BC850 的上清,以及 BC100 和 BC300 组分,单独地分装到几个 15 ml 试管(做免疫亲和纯化)和 1.5 ml 微量离心管(做免疫印迹和蛋白质分析)。
13. 液氮冷冻,存放于 -80℃ 直到使用。
14. 用免疫印迹来定位包含 FLAG 标记 TBP 的 P11 组分。
15. 按照「组成型表达 FLAG 标记」 步骤 26~34,从 P11 0.3mol/L 氯化钾组分纯化 TFIIIB 以及从 P11 0.85mol/L 氯化钾组分纯化 TFIID。
来源:丁香实验