五、cDNA 序列的分析及蛋白质一级结构的确定

1. 首先是对所得 cDNA 进行同源性的比较。通常是在 NCBl 的 GenBank 数据库中来完成，利用 Blast 程序，比较其与已知基因的同源性。

2. 判断是否为完整的 cDNA 序列：如有无 polyA，有无起始和终止密码寻找开放性阅读框架（ORF，open reading frame）等。

3. 在上述分析完成后，我们便可以根据已确定的阅读框架将核苷酸序列翻译成氨基酸序列。现在各种工具软件很多，常用的如 DNAsis 及 GoldKey 等。在 GenBank 及 Swissprot 的网站上也可进行类似的工作，它们可以按照 3' 和 5' 两个方向提供六种阅读框架的翻译结果。可从其中根据所确定的框架作常方便的任选其一。