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五、cDNA 序列的分析及蛋白质一级结构的确定

相关实验:cDNA 法推断蛋白质的一级结构实验

最新修订时间:

原理

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材料与仪器

cDNA

步骤

1. 首先是对所得 cDNA 进行同源性的比较。通常是在 NCBl 的 GenBank 数据库中来完成,利用 Blast 程序,比较其与已知基因的同源性。


2. 判断是否为完整的 cDNA 序列:如有无 polyA,有无起始和终止密码寻找开放性阅读框架(ORF,open reading frame)等。


3. 在上述分析完成后,我们便可以根据已确定的阅读框架将核苷酸序列翻译成氨基酸序列。现在各种工具软件很多,常用的如 DNAsis 及 GoldKey 等。在 GenBank 及 Swissprot 的网站上也可进行类似的工作,它们可以按照 3' 和 5' 两个方向提供六种阅读框架的翻译结果。可从其中根据所确定的框架作常方便的任选其一。

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注意事项

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常见问题

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来源:丁香实验

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