原理
对于分离宽分子量范围的蛋白质,梯度 SDS-PAGE 凝胶可提供最佳分析方法,产生更清晰的蛋白质点。通过减少凝胶中孔的尺寸,可使扩散减少。但是,梯度凝胶重复性较差,所以通常用多凝胶灌制装置来同时灌制,制作一套凝胶来进行同一系列的实验。下面讲述用多凝胶灌制系统灌制梯度凝胶的方法。
如果凝胶要用银氨方法(方案 11) 来染色,凝胶中的硫代硫酸钠可减少染色背景(HochstrasserandMerril,1988; 见表 4.6 注释)。
材料与仪器
玻璃平板 梯度制备仪 磁力搅拌子 磁力搅拌器 多梯度凝胶灌制盒 蠕动泵 吸管 夹子 隔片 真空瓶 水抽真空泵或其他抽真空系统
步骤
1.安装玻璃板之前,用乙醇浸过的无棉纸巾擦拭玻璃板,确保无灰尘颗粒粘在玻璃板表面。
实验提不:处理玻璃板的过程中要戴手套,以减少角蛋白和其他蛋白的污染。
2.对齐两块玻璃板,在两边放入 1.0mm 或 1.5 mm 隔板。
3.用不脱色的记号笔标记玻璃板距上沿 0.5 cm 处,在一些系统例如 Bio-Rad ProteanII,玻璃板不等长,应确保标记距短板上沿0.5 cm。
4.用打字机或铅笔标记一小条滤纸作为凝胶的标签。将滤纸放在凝胶框的左边底部。不要用记号笔,因其会渗人凝胶。
5.将整个凝胶框放人多凝胶灌注架中,同样将其他的凝胶框排列放于灌注架上,用薄塑料片(即隔板)将各凝胶框分隔开。这些薄片通常由多凝胶灌注架提供,但也可用聚酯薄膜板切割而成。用灌注架提供的隔板填充各个空格。夹紧灌注架上前面的玻璃板以确保垫片将灌胶空间密封好。
6.灌胶之前,向灌胶的空间加水来确定所需试剂的体积,测量体积的一半用于制备低(轻溶液),另一半用于制备高(重溶液)。用表 4.6 来计算灌胶中各个成分的体积。
7.制备准确体积的轻、重丙烯酰胺溶液,过硫酸铵与 TEMED 的体积忽略不计,各加一个小的磁力搅拌子。
8.用水抽真空泵来抽去丙烯酰胺中的气体(几分钟),同时在磁力搅拌器上搅拌。
虽然并非所有研究者都进行这步抽真空,但为了更佳的重复性,建议进行此步操作。
9.当溶液在抽真空时,将一根管子连到蠕动泵,先用水检验以确保制造商所建议泵的流速。一旦流速固定,将管一端连在梯度混合器的出口,另一端连到多块凝胶灌注仪的人口。在多块凝胶灌制装置的开口端放一个夹子,打开夹子,确保梯度混合器处于关闭的状态。
10.在混合器中将小磁力搅拌子放人,将梯度混合器放在磁力搅拌器上。
来源:丁香实验