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体外细胞核连缀反应

相关实验:细胞核连缀分析实验

最新修订时间:

材料与仪器

组织
EDTA SDS 蛋白酶 K
玻璃试管

步骤

1. 融解从 1 g 组织或 5 瓶培养皿细胞制备、冻存于 NSB 中的细胞核。1000 g 离心 5 分钟,去上清,用 200 μl HRB 轻轻吹打重悬。

2. 将悬液转至一个带有抗酚螺帽的硅化玻璃试管,37℃ 水浴 5 到 15 分钟(由预实验决定)。孵育过程中,偶尔轻轻搅动细胞核,避免沉于管底。

3. 加入 1.5 ml HSB 和 90 μl DNA 酶Ⅰ(终浓度 100 单位/ml)终止反应,37℃ 水浴 3~5 分钟,同时剧烈吹打直至不再黏稠。

4. 依次加入 40 μl 0.5 mol/L EDTA,40 μl 25% SDS 与 20 mg/ml 蛋白酶 K,混匀,37℃ 水浴 30 分钟。

5. 热酸酚抽提除去蛋白质和大部分 DNA:加 2.5 ml 抽提缓冲液,然后加等量预热到 65℃ 的由抽提缓冲液饱和的酚,于 65℃ 剧烈混合 10 分钟。

6. 将试管置于冰上 5 分钟,然后于 2000 g 离心 15 分钟分离水相与有机相。吸去下层有机相,留下水相于界面。

7. 加等量新鲜饱和酚,如第 5 步再抽提一次。

8. 将水相吸出到一个新离心管,用等量氯仿抽提一次。将上层水相吸出到一个新离心管。

9. 加 100 μg 酵母 tRNA 载体与 2.5 倍体积冰冷的乙醇,于 -20℃ 放置 1 到 18 小时沉淀 RNA。

10. 10000 r/min 离心 10 分钟,去上清,再用 1 ml TE 缓冲液重悬。

11. 如果 RNA 用作滤膜杂交的探针,最好做(也可不做)一步额外的清洗。

(1) 往第 10 步得到的 1 ml RNA 样品中加 1 ml 冰冷的 10% TCA,冰浴 10 分钟以沉淀 RNA。

(2) 合适的收集装置(如微孔滤器),通过真空抽滤将沉淀收集于一张直径 25 mm 的硝酸纤维素滤膜上,在滤器中用冰冷的乙醇清洗滤膜。

(3) 将滤膜放在一个硅化玻璃液闪计数管的底部,于 65℃ 分 2~3 次各用 1 ml 水冲洗,合并收集冲洗液。

(4) 乙醇沉淀浓缩 RNA ( 即加甲酸钠至 0.2 moI/L,加二倍体枳乙醇,于 10000 r/min 离心 10 分钟)或用真空离心蒸发干燥器浓缩 RNA。

来源:丁香实验

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