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经标记的 M13 噬菌体 DNA 的制备

相关实验:细胞系的多位点 DNA 指纹检测

最新修订时间:

原理

用随机引物延伸法标记 M13mp9 DNA [ Finberg and Voglstein,1983 ],并用葡聚糖柱(Sephadex) 纯化。

材料与仪器

模板 HEPES DTM试剂 氧核苷酸 牛血清蛋白 P-dGTP Klenow 酶
DTM试剂 OL试剂 标记缓冲液 洗柱缓冲液
Sephadex 柱

步骤

1. 在无菌小管中,将 2 μl 稀释的 M 13 DNA (0.25 ng/μl Boehringer Mannheim,以 1:4 稀释于蒸馏水中)和 11 μl 蒸馏水混匀。

2. 将小管置于沸水浴 2 min。

3. 直接将小管放入冰中 5 min。

4. 在小管中加入 11. 4 μl LS 缓冲液(标记缓冲液,LS 缓冲液,1 mol/L 的 HEPES:DTM :OL 为 100: 100:28)和 0.5 μl 的 BSA。(HEPES,1 mol/L,pH 6.6;DTM 试剂:dATP、dCTP 和 dTTP,每种各 100 μmol/L 溶解于 250 mmol/L的 Tris-HCl,25 mmol/L 的 MgCl2 及 50 mmol/L 的 2-巯基乙醇(pH 8.0)中;OL 试剂:在 1 mmol/L Tris 和 1 mmol/L EDTA中含有 90 O.D 单位的寡聚脱氧核苷酸(PH 7.5))


5. 在 Perspex 屏后面,向小管中加入 10 μl 32P-dGTP(3 Ci/mmol, Amersham international plc) 和 2 μl Klenow 酶(1 μg/μl,测序级,Life Technologies)。

6. 小管内容物混匀后短暂离心。

7. 在 Perspex 屏后,室温下孵育试管。

8. 用移液管小心地将小管中的液体移到预先用 10 ml 洗柱缓冲液(10 mmol/L Tris-HCl, pH 7. 5,1 mmol/L EDTA)平衡的 Sephadex 柱(如 NICK 柱, Amersham Pharmacia)中。

9. 用洗柱缓冲液 400 μl 洗 2 次,收集第 2 次 400 μl 的洗出液作为纯化的探针。

10. 煮沸纯化探针 2 min 后,置于冰上冷却,再与杂交液混合。

注意事项

1. 2-巯基乙醇可挥发且有毒性。

2. 32P 产生高能量的 β 粒子,应尽量减少暴露,操作要戴手套,使用 1 cm 厚的 Perspex 屏。

3. 由于柱内残留未结合的核苷酸, 所以仍有很高的放射性。

4. 涉及放射性物质的操作,应该按照国家和当地条例进行操作,开展这样的工作之前要向当地生物安全部门咨询。

来源:丁香实验

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