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DNA ladder法

相关实验:细胞凋亡检测实验

最新修订时间:

原理

发生细胞凋亡时,内源性核酸酶被激活,染色体DNA链在核小体之间被切割,形成180~200个碱基或其整数倍的DNA片段,将这些DNA片段抽提出来进行电泳,可得到DNA梯状条带(DNA ladder)。

材料与仪器

凋亡细胞
蛋白酶K 醋酸钾 白细胞裂解液 Tris-HCl NaCl EDTA SDS 乙醇 琼脂糖
离心管 离心机 水浴锅 电泳仪 电泳槽

步骤

一、材料与试剂准备
1. 材料:凋亡细胞。
2. 蛋白酶K(500 μg/ml), 醋酸钾氯仿(8 mol/L),无水乙醇,70%乙醇,2%琼脂糖凝胶。
3. 白细胞裂解液:pH8.0,10 mmol/L Tris-HCl,10 mmol/L NaCl,10 mmol/L EDTA,1% SDS。
二、操作步骤
1. 收集凋亡细胞:取1~2×106 个细胞,离心后,立即用70%酒精(-20℃)固定2 h。
2. 洗涤:取出酒精固定的细胞,1 000 r/min离心5 min ,去掉上清液,PBS洗二次。
3. 裂解细胞:加400 μl细胞裂解液,充分混匀再加蛋白酶K 100 μl,置65℃水浴消化2小时或过夜。
4. 蛋白处理:加75 μl 8 mol/L的醋酸钾,4℃15 min,再加750 μl氯仿,充分混匀后,10 000 r/min离心10 min后,将上清移至一新的Eppendorf管中。
5. 沉淀DNA:加入750μl无水乙醇,上下轻柔颠倒混合,即可见乳白色沉淀,若不明显时可置-20℃过夜,12 000 r/min离心10 min,去上清。
6. 洗涤DNA:加1 ml 70%乙醇,混匀,10 000 r/min 离心5 min,去上清。
7. 溶解DNA:根据 DAN 沉淀的大小,加一定量的蒸馏水或TE,37℃溶解。
8. 测定DNA浓度。
9. 2%琼脂糖凝胶电泳80 V 2小时。
三、结果判断
出现梯状电泳条带,最小的条带为180~200 bp,其他的条带为其整倍数大小。坏死细胞则出现弥散的电泳条带,无清晰可见的条带。正常细胞DNA基因条带因分子量大,迁移距离短,故停留在加样孔附近。

来源:丁香实验

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