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染色质免疫沉淀

实验分类:

遗传学实验

别名:

chromatin immunoprecipitation,ChIP

最新修订时间:

简介

染色质免疫沉淀法(chromatin immunoprecipitation,ChIP)是研究体内蛋白质与DNA相互作用的一种技术。

真核生物的基因组DNA以染色质的形式存在,研究蛋白质与DNA在染色质环境下的相互作用是阐明真核生物基因表达机制的基本途径。

ChIP利用抗原抗体反应的特异性,可以灵敏地检测目标蛋白与特异DNA片段的结合情况,是目前确定与特定蛋白结合的基因组区域、与特定基因组区域结合的蛋白质的最好方法。

ChIP常用于研究转录因子(transcription factor,TF)与启动子(promoter)相互结合,研究组蛋白(Histone)的各种共价修饰与基因表达的关系等。

染色质免疫沉淀技术一般包括细胞固定,染色质断裂,染色质免疫沉淀,交联反应的逆转,DNA的纯化,以及DNA的鉴定。

原理

染色质免疫沉淀的基本原理是在生理状态下把细胞内的DNA与蛋白质交联、固定在一起,通过超声或酶处理将染色质随机切断为一定长度范围内的染色质小片段。

用所要研究的目的蛋白特异性的抗体沉淀这种交联复合体,特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段,通过对目的片断的纯化与检测,从而获得蛋白质与DNA相互作用的信息。

应用

染色质免疫沉淀常用于研究转录因子(transcription factor,TF)与启动子(promoter)相互结合,研究组蛋白(Histone)的各种共价修饰与基因表达的关系等。

来源:丁香实验团队

操作方法

染色质免疫沉淀

染色质免疫沉淀法(chromatin immunoprecipitation,ChIP)是研究体内蛋白质与DNA相互作用的一种技术。真核生物的基因组DNA以染色质的形式存在,研究蛋白质与DNA在染色质环境下的相互作用是阐明真核生物基因表达机制的基本途径。ChIP利用抗原抗体反应的特异性,可以灵敏地检测目标蛋白与特异DNA片段的结合情况,是目前确定与特定蛋白结合的基因组区域、与特定基因组区域结合的蛋

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