T4 噬菌体多核苷酸激酶催化的交换反应(Van de Sande et al. 1973; Berkner and Folk 1977) 是一个标记 5' 端 DNA 的快速方法。与正向反应不同的是,它无需 DNA 去磷酸化。正向反应在略偏酸性(pH 6.4)的咪唑缓冲液中进行,以刺激酶促去磷酸化 (Berkner and Folk 1977)。交换反应的最佳 Km 值(ADP 为 300 μmol/L,ATP 为 10 μmol/L),均比在试验管中容易达到的值高,因此标记效率很少超过 30%。然而,交换反应效率通过在反应混合物中加入亚精胺和聚乙二醇大为改善(Lillehauget al. 1976; Harrison and Zimmol/Lmerman 1986a)。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。
用交换反应进行5'突出端DNA分子的磷酸化一、材料
1. 缓冲液和溶液
ADP (1 mmol/L)
乙酸铵(10 mol/L)
ATP (10 mmol/L)
EDTA ( 0.5 mol/L,pH 8.0)
乙醇
10X 咪唑缓冲液(500 mmol/L 咪唑盐酸(pH 6.4),180 mmol/L MgCl2,50 mmol/L DTT,1 mmol/L 亚精胺盐酸,1 mmol/L EDTA (pH 8.0))