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单亲二倍体的分子检测实验
单亲二倍体(UPD) 细胞可以有正常的细胞遗传核型但是亲代的贡献不平衡。诊断单亲二倍体需要分析患者和其父母的 DNA 标本基因型,如评估分子多态现象的遗传性。进行此方面的分析最常用微卫星分析,包括多态性短串联重复 (STR) 位点的 PCR 扩增和聚丙烯酰胺凝胶电泳,根据带型的大小加以区分。有时,单亲二倍体仅仅是「部分」的,也就是仅仅包括染色体的一个区域。这样就要求仔细选择分子标记以确保单亲二倍体区域不被漏检。对于一些染色体来说,父母双方同源基因甲基化的不同也可以用来筛查单亲二倍体。甲基化方法
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荧光基因分型筛查微小亚端粒重排实验
我们的研究结果强有力地支持微小端粒重排在自发性智力障碍中发挥着非常重要作用的观点(我们实验中约有 12%),并证明荧光基因分型是检测微小端粒重排非常灵敏的方法。此外,相对于需要较多技术经验、结果变动性大的细胞遗传学分析而言,多方面自动化的基因分型在定量和结果客观方面具有优势;基因分型的优点还包括可以直接识别重排染色体的双亲来源。最后,微卫星 DNA 技术在发现与若干人类疾病机制相关的单亲二倍体方面有独特的优势。来源:《分子细胞遗传学技术与应用》
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单亲二倍体的分子检测
一、PCR 反应实验程序1.准备 PCR 反应混合物:根据 DNA 样本的数量来确定除了 DNA 外其他混合物的体积(额外增加一份来确保有足够的 PCR 反应混合物),将扩增每一个遗传标记并且在每一个 PCR 反应管内分 19.5uL 的反应混合物。2.在每个管子中加 0.5, 的 DNA 样本。3.如果不用带有加热盖的 PCR 仪,那么就需要在每个管子的顶部加入矿物油来防止液体蒸发。4.把管子放在 PCR 仪中,95℃加热 3 min 变性 DNA。5.95℃ 变性 40s、55℃ 引物
操作方法所属实验:单亲二倍体的分子检测实验
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胚层分化

)的分化,形成外胚层(ectoderm)、中胚层(mesoderm)和内胚层(endoderm)。 哺乳动物原肠胚形成过程中,母体基因组和父体基因组起着不同的作用。由单亲染色体加倍生成的二倍体合子可发育成单亲二倍体小鼠胚胎。由父体来源的单亲二倍体小鼠胚胎可以进一步发育生成正常的绒毛膜,但胚胎却因有缺陷而死亡;而母体来源的单亲二倍体小鼠胚胎能发育成正常的胎鼠,可是却因绒毛膜的缺陷而死亡。这提示,精子来源的基因可能是绒毛膜正常发育所需,而卵来源的基因则为胎儿发育本身所必需。异决表型小鼠的实验也证实

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NCB:张勇 / 高绍荣 / 刘文强合作揭示小鼠早期胚胎发育中潜在的印记控制区域

K9me3 修饰有助于这些区域逃脱 DNA 去甲基化。研究人员开发了计算生物学工具 PCAR 去识别共同标记 H3K9me3 和 DNA 甲基化的 CpG 富集区域(CHM),并发现 CHM 是小鼠植入前胚胎中 DNA 甲基化维持的热点区域。 为了高分辨率地探究亲本间 CHMs 的差异,研究人员在孤雌、孤雄胚胎中产生了单亲本的 H3K9me3 和 DNA 甲基化数据,鉴定出 1,279 个亲本特异性 CHM(asCHM),其中包括 19 个已知的 ICR。与 ICR 类似,asCHM 中近一半从配子中

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遗传工程与近交系的发展

上皮细胞移行规律及其定位等。 2.单亲纯合双倍体动物的育成。单亲纯合双倍动物育成技术又称为雌核发育技术。这是一种相当于植物中由花粉培育成纯合双倍体植株的技术,其结果都是培育出具有两套完全一致的染色体及基因的个体。 众所周知,不论在生产上还是在科学试验中都需要纯系动物。为了得到一个纯系动物,一般要花费数年时间,甚至一生的光阴。既使对世代周期较短的小鼠,采用了最有效的兄妹交配方法,还需要连续兄妹交配20代以上才能获得纯系动物,这也要几年时间。如果采用单亲纯合双倍体育成的技术来育成一个纯系动物,则将大大

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遗传工程与近交系的发展

上皮细胞移行规律及其定位等。 2.单亲纯合双倍体动物的育成。单亲纯合双倍动物育成技术又称为雌核发育技术。这是一种相当于植物中由花粉培育成纯合双倍体植株的技术,其结果都是培育出具有两套完全一致的染色体及基因的个体。 众所周知,不论在生产上还是在科学试验中都需要纯系动物。为了得到一个纯系动物,一般要花费数年时间,甚至一生的光阴。既使对世代周期较短的小鼠,采用了最有效的兄妹交配方法,还需要连续兄妹交配20代以上才能获得纯系动物,这也要几年时间。如果采用单亲纯合双倍体育成的技术来育成一个纯系动物,则将大大

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基因组印记

不稳定性常常可导致胚胎发育的异常利用平衡易位(如相互易位和罗伯逊易位)获得的杂合胚胎是印迹基因研究较好的一个模型,这是因为:相互易位和罗伯逊易位可用于产生单亲二倍体(UPD),或在染色体的全部或局部区域产生单亲的复制位点或缺失位点(uniparental duplication/defi ciency)。携带有UPD 或 uniparental duplication/deficiency 的小鼠具有正常二倍染色体的成分,然而,父母源基因可能会受到干扰,结果使小鼠的某些遗传秉承单亲的特性。遗传

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从SNP原理谈SNP分析技术之SNP芯片

探针外,还有90多万个用于拷贝数变化(CNV)检测的探针,可使全基因组平均分辨率达3 kb,既可用于全基因组SNP分析,又可用于CNV分析,真正实现了一种芯片两种用途,方便研究者挖掘基因组序列变异信息。通过基因分型信息还可以鉴别中性拷贝数的杂合性缺失(copy neutral LOH)、单亲二体病(UPD)及嵌合现象(可以精确检测到20% 嵌合体)。近来Affymetrix 公司又陆续发布了多款针对东亚、中国、欧洲、非洲等不同人群的SNP基因分型芯片,采用GeneTitan平台进行高通量检测,极大

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克隆技术

细胞 本身是通过有性繁殖的,其细胞 核中的基因组一半来自父本,一半来自母本。而“多莉”的基因组,全都来自单亲,这才是真正的无性繁殖。因此,从严格的意义上说,“多莉”是世界上第一个真正克隆 出来的哺乳动物。其特点就在于它与为它提供遗传物质的供97年2月23日,英国苏格兰罗斯林研究所的科学家宣布,他们的研究小组利用山羊的体细胞 成功地“克克隆 技术是科学发展的结果,它有着极其广泛的应用前景。在园艺业和畜牧业中,克隆 技术是选育遗传性质稳定的品种的理想手段,通过它可以培育出优质的果树和良种家畜。在医学领域,目前美国

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长度多态性分型

上增加了特点,尤其是单亲父女关系的亲权鉴定。对于父女关系的单亲,既不能应用父系遗传的Y染色体基因座,也不能应用母系遗传的线粒体DNA分析,但可以用X-STR基因座分析父女单亲关系,父亲的X染色体必遗传给其女儿。如果女儿的X-STR基因座的等位基因与被假定的父亲不同,可以直接排除其父女关系,如果相同,则不能排除其父女关系,可以结合常染色体STR确定是否存在父女关系。对于同父异母姐妹血缘关系鉴定的案件,若没有双亲参与检验,常染色体STR无法确定姐妹关系,线粒体的多态性标记也不能用来确定同父所生的关系

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对野牛基因组的艰苦搜寻

这些牛是从我们欧洲牛的一个不同的土著群体传下来的;几位称职的法官认为,这些牛的父母不止一个。”第一章:驯化下的变异,关于物种的起源(1859)这段引自《物种起源》的引文表明,19世纪的养牛专家认为,欧洲牛很可能有多方面的遗传起源,“不止一个野生亲本”随着第一个完整的野牛核基因组序列的公布,现在很明显,这些维多利亚时代的繁殖者是非常有先见之明的。我们和其他人提出的基于单亲线粒体和Y染色体DNA分析的家养牛进化的简单模型需要进行修改,以便更细致地了解家养牛和野牛之间的杂交和基因流动,因为早期欧洲农民迁入

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 国内外实验动物科学发展情况

保种和遗传研究中心。仅NIH实验动物资源中心就维持着250种近交系大小鼠,不同背景的无胸腺裸鼠有20多种,其中重组近交系的培育成功是哺乳类动物遗传学中的一个重要进展,并已广泛用于新的多态型基因位点和新的组织相溶性位点的鉴定和多态型位点的多效性以及其连锁关系的研究。同时,也广泛应用于感染性、自发性、诱发性等病变的研究及生物学、药理学、形态学和行为学等方面的研究。   目前,各国都利用基因调控原理进行嵌合体和单亲纯合又倍体动物的研究。嵌合体动物也称异型动物或四亲动物,这种动物可用于细胞

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对原牛基因组的艰苦搜寻

什么意见。根据布莱斯先生告诉我的事实,就驼背的印度牛的习性、声音和体质而言,我认为这些牛是从我们欧洲牛的另一种土著牛种上遗传下来的;几个称职的专业评判员认为,后者有不止一个野生的父母。”第一章:驯化下的变异,物种起源(1859)这段引自《物种起源》的话表明,19世纪的养牛专家认为,欧洲牛很可能有着多方面的遗传起源,“……不止一个野生亲本。”随着第一个完整的野生原牛核基因组序列的公布,现在很明显,这些维多利亚时代的繁殖者非常有先见之明。我们和其他人提出的基于单亲线粒体和Y染色体DNA分析的家牛进化的简单

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 国内外实验动物科学发展情况--国外发展情况

  目前,各国都利用基因调控原理进行嵌合体和单亲纯合又倍体动物的研究。嵌合体动物也称异型动物或四亲动物,这种动物可用于细胞谱系、实验胚胎学、发生遗传学以及免疫学等研究领域。单亲纯合双倍体动物育成技术又称为雌核发育技术,是近几年中发展起来的技术,这种新技术的试验成功,可大大加快新品种的培育。使需要100年才能育成的实验动物,只用一年的时间就可完成,并可在纯合过程中,解决致死基因造成的胚胎期死亡问题。各国实验动物研究的另一个动向是各种病理模型动物的培育。现已培育成功许多种遗传突变型的免疫缺陷动物

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 国内外实验动物科学发展情况--国外发展情况

  目前,各国都利用基因调控原理进行嵌合体和单亲纯合又倍体动物的研究。嵌合体动物也称异型动物或四亲动物,这种动物可用于细胞谱系、实验胚胎学、发生遗传学以及免疫学等研究领域。单亲纯合双倍体动物育成技术又称为雌核发育技术,是近几年中发展起来的技术,这种新技术的试验成功,可大大加快新品种的培育。使需要100年才能育成的实验动物,只用一年的时间就可完成,并可在纯合过程中,解决致死基因造成的胚胎期死亡问题。各国实验动物研究的另一个动向是各种病理模型动物的培育。现已培育成功许多种遗传突变型的免疫缺陷动物

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家庭环境与儿童心理素质

者,待人接物的指导者,孩子成长的责任人,因此有责任去构建良好的家庭环境,掌握正确的教养态度和方法,使家庭呈现——民主、和谐、 平等的融洽气氛,才能培养孩子讲责任,讲民主、讲勤奋、讲进步,不骄不宠,自尊自强的好品格。   三、家庭结构的变化是影响良好心理素质的严重障碍。   近年来由于独生子女的普遍,社会经济、文化的飞速发展,人们的价值观念的急剧变化 ,家庭结构也随着发生变化,表现在单亲家庭不断出现,家庭结构的稳定正在动摇,再婚率不断上升,伴随而来的是家庭的解体与重构。家庭

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按遗传学控制原理分类

、重组近交系动物、突变系动物、杂交F1代动物、单亲二倍体动物和嵌合体动物。不同基因动物一般是指远交系动物和封闭群动物。每种动物在遗传学、生物学特性上和应用上都各具特点。 同基因型动物主要以近交系动物为代表,在繁殖中根据目的不同分别采用近交、杂交、或连续回交、或回交互交等特殊的方式培育而成。 不同基因型或杂合型的动物主要来源于远交杂种或近交纯种的动物,一般称为远交系动物或封闭群动物。种子来源于近交系或有近交历史的动物。其基因纯度与近交系相比差异不大,来源于没有近交历史的种群而繁殖的远交

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按遗传学控制原理分类

、重组近交系动物、突变系动物、杂交F1代动物、单亲二倍体动物和嵌合体动物。不同基因动物一般是指远交系动物和封闭群动物。每种动物在遗传学、生物学特性上和应用上都各具特点。 同基因型动物主要以近交系动物为代表,在繁殖中根据目的不同分别采用近交、杂交、或连续回交、或回交互交等特殊的方式培育而成。 不同基因型或杂合型的动物主要来源于远交杂种或近交纯种的动物,一般称为远交系动物或封闭群动物。种子来源于近交系或有近交历史的动物。其基因纯度与近交系相比差异不大,来源于没有近交历史的种群而繁殖的远交

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常用生物软件(Windows 版)

和寡核苷酸引物序列)。在一个项目中可以加入几千个序列或引物,并在整个项目中分析这些序列及标题。这个程序的一个特点是给每个序列或引物添加文本标题。这样就可以用自定义的标题识别序列,而不必通过它们的文件名。 Bioedit一个具有序列简单分析和序列对比功能的软件。该软件有一个简单亲切的界面,集成其他已经很有效果的序列比对软件。另外该软件还有很多有用的相关站点连接。虽然该软件看起来结构简单,但却又很强的可充性,可以自由整合许多软件,例如viewtree. Jellyfish 2.1 只水母不简单

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