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有没有用于生信分析专用的蛋白质组学测序相关的公共数据库?

相关实验:蛋白质组数据的多元分析实验

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Young_Zzzl

肿瘤领域的数据库比较多,想知道非肿瘤领域的数据库有吗?

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3 个回答

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土井挞克树

有帮助

可以试一下这个数据库ProteinData Bank

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于小鱼鱼1998

有帮助

有的,有专门的蛋白的数据库比如uniprot

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sswei

有帮助

蛋白质组数据库


1.GELBANK

网址:http://gelbank.anl.gov

简介:提供全基因组的二维凝胶电泳图谱,搜集了已知基因组信息生物的蛋白质组二维凝胶电泳图。可通过描述相对分子质量、等电点和蛋白质序列信息进行快速检索。


2.SWISS-2DPAGE

网址:http://www.expasy.org/ch2d/

简介:提供人类、小鼠、大肠杆菌、酿酒酵母、盘基网柄菌的2D-PAGE参考图。


3.SysPIMP(Systematical Platform for Identifying Mutated Proteins)

网址:http://pimp.starflr.info/

简介:通过质谱技术建立的蛋白质突变数据库。当蛋白质某一氨基酸残基发生改变时,其质谱图也会发生改变,通过蛋白质质谱图的改变,检测与疾病相关的突变。


4.Sys-BodyFluid

网址:http://www.biosino.org/bodyfluid/

简介:人体体液蛋白组研究数据库。提供人体各种体液的蛋白质组数据,包括血浆/血清、尿液、乳汁、泪、汗液、唾液、骨髓液、脑脊液、胃液等。


5.BloodExpress

网址:http://hscl.cimr.cam.ac.uk/bloodexpress/

简介:小鼠造血过程基因表达数据库


6.CentrosomeDB(human centrosomal proteins database)

网址:http://centrosome.dacya.ucm.es

简介:人体中心体蛋白数据库


7.ConsensusPathDB

网址:http://cpdb.molgen.mpg.de

简介:人类功能作用网络数据库,与多个数据库有交叉应用,提供蛋白质互作、生化反应、基因调控等作用网数据。


8.Proteome Analysis Database

网址:http://www.ebiac.uk.proteome/

简介:蛋白质组分析数据库


10.HPRD(Human Protein Reference Database)

网址:http://www.hprd.org/

简介:人体蛋白文献数据库

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