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求助 |生信筛选DEGs和KM曲线结果分析的相关问题

相关实验:食品中大肠菌群的测定实验

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你的老徐XR

我想问各位大神几个问题:1、我想从TCGA和GEO数据库中选择自己的DEGs,想问下log2FC的取值可以不一样吗?比如TCGA数据库的用log2FC大于1,GEO数据库的用log2FC大于0.5。2、在GEPIA里面看生存曲线,有两个p值,Logrank p和p(HR),请问以哪一个为准呢?以Logrank p为准可以吗?谢谢各位大神!

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1 个回答

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Eason老歌迷

有帮助

log2FC的取值最好是一样!TCGA数据库的用log2FC大于1,GEO数据库的也用log2FC大于1。在GEPIA里面看生存曲线,有两个p值,以Logrank p为准。

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