小葵花妹妹
大部分均提到:甲基化引物对与非甲基化引物对分别根据待测序列的CpG位点甲基化与非甲基化时,经亚硫酸氢钠转化后的序列设计。甲基化引物对与非甲基化引物对只能分别扩增甲基化与非甲基化的基因片段,由此达到检测基因甲基化的目的。(我理解的是如果该片段存在甲基化位点,则使用未甲基化引物是扩增不出来的)
我在进行试验时,使用MethPrimer设计了两对引物:甲基化引物和非甲基化引物(扩增位置一致)。用同一模板进行扩增。测序时,发现甲基化引物存在甲基化位点,而使用未甲基化引物也扩增出来了片段,是没有甲基化位点的序列。大家会出现这一现象吗?还是说明亚硫酸盐处理DNA不彻底?这个结果可以认为存在甲基化位点吗?后续进行甲基化程度分析时,是只使用甲基化引物扩增的结果吗?
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