菌株鉴定
端端UURK
请问16s rRNA进化树鉴定结果与全基因组 ANI分析鉴定结果不一样，写文章的时候该怎么写呢？16s和全基因组的序列已经上传NCBI数据库了，但显示的是两种菌，哪位大佬知道该怎么解决啊？
2 个回答
Dr_劉医生
写rRNA的转录鉴定结果，而且你上传了NCBI数据库后会分配ID号，到时投稿会用到；至于你说的和全基因组序列的结果不一样，是不是你看的是碱基是DNA的，而鉴定是转录本；还一个确定好sapien还是animals,一般情况不会出现两种菌。
Eason老歌迷
上传了?全基因组和16sr测序结果不一样，可能是测序深度不一样，16S rDNA扩增子测序虽然测序数据量不高，但是针对16S序列的一部分来说深度是非常足够的。但是全基因组针对的是群里里面的所有细菌基因组，10G的测序数据量所能覆盖的基因组序列范围以及所覆盖区域的深度未必足够，在这种情况下对于物种的定量来说可能会产生较大的差异，在这基础上进行差异分析所找到的差异物种自然也会存在不同。
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