蛋白质组学，网络药理学找差异蛋白？

蛋白质组学和转录组学都是从基础研究水平上来缩小我们实验的范围，运气好，能够碰到一个单基因控制的，或者相互作用网络比较简单的蛋白，我们就能具体解决某一个问题，但大部分时候只能够给我们提出一个方向。

你可以试试啊，如果在两种方法里都高/低，那不就更能说明问题啊。

DIA（data-independent acquisition）指数据非依赖型扫描模式，是基于静电场轨道阱Orbitrap的一种全息式的质谱数据采集模式。相对于DDA（数据依赖性的扫描模式），DIA技术将质谱整个扫描范围分为若干个窗口，对每个窗口中的所有离子进行选择、碎裂、检测，具有更好的准确性和可重复性。

PRM（parallel reaction monitoring）是一种基于高分辨率和高精度质谱的离子监测技术，是目前靶向蛋白质组学数据采集的主流方法，通过对特异性肽段或目标肽段（如发生翻译后修饰的肽段）进行选择性检测，从而实现对目标蛋白质/修饰肽段的靶向相对或绝对定量。

DIA和PRM结合进行蛋白质组学研究，可以实现大样本量或复杂样本的检测和目标蛋白的精确定量，尤其可以提高低丰度目标蛋白质的检出率。