天一湖医者
代谢组学分析数据用于统计分析时,数据集通常为一个N × K的矩阵(X矩阵),N表示N个样本数,每一行代表一个样品, K表示K个变量,每一列代表一个变量,在代谢组学中变量通常是指代谢物含量。最常用的分析方法如图
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代谢组学数据分析可分几个步骤:对检测得到的原始数据进行数据预处理、数据质控、代谢物定性定量、通过生信分析挖掘数据。
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1.数据预处理。如缺失值过滤填充、数据归一化等。
2.数据质控。包括CV分布、QC等。
3.统计分析。包括单变量、多变量等。
4.功能分析。包括Pathway、网络分析、Biomarker筛选等。
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如果你不会用python和r的话,你找给你测数据公司,让他们帮你分析,他们都有成套路的模版的。
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