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检测RNA病毒,使用一步法还是两步法?

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acejandro本尊

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6 个回答

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天一湖医者

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一步法

优点: 只需一步,反应发生在单管中,速度比两步法更快,而且需要较少的准备和操作时间。

处理大量样品时易于操作,减少污染的机会。

整个cDNA样品都被扩增,灵敏度更高。

缺点: 同一样本只有有限数量的目的基因被扩增。另一个挑战是组分的兼容性,因为一步法需要转录和扩增之间的平衡。

两步法

优点: 可以分析同一样本的多个目标。

逆转录步骤将样本中所有的RNA转换为cDNA,可以储存cDNA用于后续实验,检测大量基因能够分别优化RT和PCR步骤,可以更好地控制实验过程。因为只有少量的转录材料用于PCR,任何可能从RNA分离到RT反应的抑制剂(如乙醇、苯酚或胍盐)都被稀释了。

缺点:它更耗费时间,且带来污染的可能性更高。RT步骤转录所有的RNA以相同的效率,选择这种方法时,应该考虑到启动会影响qPCR的结果。例如,以oligo-dTs 和随机六聚体启动反应可能会带来不同的结果。因此,对于每个RT反应应该使用相同的条件。

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迟C迟

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RT-PCR包括2步:

1、mRNA逆转录为cDNA;

2、cDNA做模版的PCR。

合而为一就是一步法,分开就是两步法。

逆转录为cDNA后更容易保存,使用效果更稳定;

一步法更快捷,但重复性不好。

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bqejjh123

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RNA病毒定量不可以用质粒,可用假病毒或培养病毒,一般均用一步法,否则易污染,较好的一步法试剂有ABI、BIODAI、QIAGEN等。

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dxywode

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建议还是使用一步法吧,这样污染上小点,有使用过的BIOGHSC Super MultiProbe One Step Kit ,是一步法中效果较好的,CT扩增的起跳点更早。
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lyang556

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一步法和两步法各有优点,不能一概而论。如果想对同一样本同时扩增2个以上的基因,那么一步法是从RNA开始的, 即分别取相同量的RNA,然后逆转录,然后加入不同的primer PCR,如果想快速获得某一种基因,当然一步法好,方法简单,但逆转录酶很贵。如果两步法,可将RNA逆转录为cDNA,然后每次加入相同量的cDNA,再加不同的引物PCR,这样可比性强, 而且不需逆转录,直接PCR即可。

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bamboopiggy

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一步法更方便,更安全一些。毕竟新冠以后,大家对rna病毒,心有余悸。

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