SUMO化IP该用什么裂解液

如果互作特别强的话用RIPA是可以的，但是如果不确定互作的强弱或者说互作没那么强，用IP专用裂解液会好一些。也可以自己配的，因为有不同的ph，要做

预实验来摸索一下你的细胞系和蛋白的最适裂解

PH。当然也可以买商品化的IP裂解液

如果互作特别强的话用RIPA裂解液，如果不确定互作的强弱或者说互作没那么强，用IP专用裂解液会好一些。也可以自己进行配制。

对于SUMO化蛋白的免疫共沉淀实验,选择裂解液确实需要权衡:

1. 如果使用过强的裂解液,例如含高浓度SDS的裂解液,会破坏蛋白间的相互作用。

2. 但是如果裂解液过弱,一些蛋白可能裂解不充分,导致结果误判。

3. 综合考虑,我的建议是:

(1) 优先选择含较弱去污剂的裂解液,例如1% NP-40加Protease抑制剂。

(2) 如果目标蛋白裂解不充分,则适当增加一种强去污剂的用量,例如SDS到0.1%。

(3) 同时需要补充EDTA等抑制去SUMO化酶,防止实验过程中脱SUMO化。

(4) 做好对照组以评估不同裂解液的影响。

(5) 如果可能,可以做定量实验如Western blot近似定量不同裂解液条件下的结果。