尛哲先森
miRNA靶基因验证,双荧光素酶报告基因实验
实验分组说明:
miRNA(目的miRNA)
miRNA-NC(阴性对照)
pmir-GLO(报告质粒空载)
pmir-WT(加了含靶基因结合位点的3'UTR片段)
结果:
miRNA能显著降低pmir-WT的荧光素活性,符合预期。然而,miR-NC也能使得pmir-WT的荧光素活性下降,此处百思不得其解。
难道是加上去的序列片段能直接影响质粒上荧光素酶活性?
更改3'UTR长度重新构建报告质粒,结果还是一样。
又进行实验,更换转染试剂进行对比,更换双荧光素酶检测盒子进行对比,结果均得到miR-NC也能使得pmir-WT的荧光素活性下降。
有没有友友遇到同样情况的,请教一下怎么处理才行
啦啦啦FCB7
我也是,目前还没有找到解决方法
土井挞克树
加上的序列片段会通过表达影响的荧光素酶活性。
loveliufudan
这种情况可能是由于报告质粒pmir-WT本身存在结合其他蛋白质或RNA的结构,导致其荧光素活性受到影响。也有可能是miR-NC具有一定的非特异性作用,与pmir-WT中的其他序列结合导致其荧光素活性下降。
为了确定问题的原因,可以尝试进行以下实验或措施:
使用不同的靶基因结合位点,验证miR-NC是否也会对其荧光素活性产生影响。如果是,则可以考虑更换报告质粒或靶基因结合位点的设计。
对pmir-WT进行序列分析,确定是否存在其他可能的结合靶点,从而确定miR-NC是否与这些靶点发生相互作用。
对pmir-WT进行mutant构建,将靶基因结合位点进行变异,观察miR-NC对其荧光素活性的影响是否减弱或消失。
鉴定报告质粒是否存在其他问题,例如插入序列长度、序列方向、序列完整性等等。
考虑使用其他检测方法进行验证,例如RNA干扰、西方印迹等方法,以确定miR-NC对靶基因的影响。
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