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请问细菌基因组三代测序提DNA有什么注意的点吗?

相关实验:TRlzol 试剂一步分离 RNA 实验

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hgfz

因为公司不接病原菌,所以只能自己提基因组DNA,但是三代测序要组装,我怕自己提的话大片段DNA会断裂,我自己也不知道,请问有推荐的试剂盒自己操作步骤参考吗?

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2 个回答

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huarenqiang5

有帮助

离心柱漂洗完成后,尽可能烘干柱膜上残留乙醇,残留乙醇会影响洗脱效率和下游实验效果;如果A260/230值过低,说明样本提取过程中,漂洗不彻底,有盐离子残留,建议增加漂洗次数;

对于基因组DNA提取,A260/280值如果低于1.7说明有可能存在蛋白污染,如果值大于1.9,说明可能存在RNA污染;如果洗脱样本时没有使用BufferEB,而使用ddH20,比值或偏低,因为Ph值会影响吸光值,并不表示样本纯度低;

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土井挞克树

有帮助

1.待提取样本尽量避免反复冻融,否则会导致提取的DNA片段降解或者DNA得率严重下降;

  2.试剂盒中BufferEB中含有少量EDTA,可能影响下游实验,使用时适当稀释,如果用其他洗脱液洗脱,要确保PH>7.5,PH过低影响洗脱效率;

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