原理
TRIzol 试剂是分离细胞和组织总 RNA 的即用型试剂,该试剂含有酚和硫氰酸胍单相溶液是 Chomczynski 和 Sacchi 进一步分离 RNA 方法的进一步改进。在匀浆或裂解样本过程屮,TRIzol 试剂不仅可裂解细胞,而且可保持 RNA 的完整。加入氯仿后离心,溶液则分为水相和有机相,RNA 绝大部分保留于水相,RNA 转到水相后,用异内醇沉淀以获的 RNA,移去水相后,样本中的 DNA 和蛋白质吋用连续沉淀获得。用乙醇沉淀吋在中间相获得 DNA. 异丙醇沉淀可在有机相获得蛋白质。
该技术适于在人、动物、植物、细菌少量组织(50〜l00 mg) 和细胞(5X104 )以及大量组织(≥lg) 和细胞(5X107) 中分离 RNA,效果很好,整个过程可在 l h 内完成。用 TRIzol 试剂分离的总 RNA 没冇蛋白质和 DNA 的污染,可用于 Morrhernblot 分析、斑点杂交、pdy(A) 选择、体外翻译、RNase 保护分析、分子克隆等。TRIzol 试剂易于分离不同大小分子质量的各 RNA,如从大鼠肝内分离的 RNA, 琼脂糖电泳后,在 7kb 和 15kb 显示出了不同的高分子质量的RNA 条带,两个主要的核糖体 RNA 带在约 5kb (28S) 及约 2kb (18S) 处;低分子质量的RNA 0.1-0.3 kb (tRNA,5SRNA) .。分离的 RNA260/280= 1.6〜1.8。每 mg 组织 RNA 的产置为:肝和脾,6〜10 ug。肾 3〜4 ug,骨骼肌和脑 1〜5 ug,胎盘 1〜4 ug。从 1X106 个细胞获得 RNA 的量是:上皮细胞,8〜15 ug;成纤维细胞 5〜7 ug。现在已冇多种 TRIzol 类似产品可供使用。
该技术适于在人、动物、植物、细菌少量组织(50〜l00 mg) 和细胞(5X104 )以及大量组织(≥lg) 和细胞(5X107) 中分离 RNA,效果很好,整个过程可在 l h 内完成。用 TRIzol 试剂分离的总 RNA 没冇蛋白质和 DNA 的污染,可用于 Morrhernblot 分析、斑点杂交、pdy(A) 选择、体外翻译、RNase 保护分析、分子克隆等。TRIzol 试剂易于分离不同大小分子质量的各 RNA,如从大鼠肝内分离的 RNA, 琼脂糖电泳后,在 7kb 和 15kb 显示出了不同的高分子质量的RNA 条带,两个主要的核糖体 RNA 带在约 5kb (28S) 及约 2kb (18S) 处;低分子质量的RNA 0.1-0.3 kb (tRNA,5SRNA) .。分离的 RNA260/280= 1.6〜1.8。每 mg 组织 RNA 的产置为:肝和脾,6〜10 ug。肾 3〜4 ug,骨骼肌和脑 1〜5 ug,胎盘 1〜4 ug。从 1X106 个细胞获得 RNA 的量是:上皮细胞,8〜15 ug;成纤维细胞 5〜7 ug。现在已冇多种 TRIzol 类似产品可供使用。
材料与仪器
氯仿 异丙醇 乙醇 无RNase的水 SDS溶液 TRIzol 试剂
步骤
一 材料与设备
1)氯仿
2)异丙醇
3)75%乙醇(用DEPC水配制)
4)无RNase的水(将水加入无 RNase 的玻璃瓶内,加浓度为0.1 % ( V /V)的DEPC过夜 ,尚压灭菌)
5)0.5%SDS溶液(必须DEPC处理过的高压灭菌水配制 )
6)TRIzol 试剂
二 操作方法
1 . 匀浆
1 ) 组织:每 50〜l0 mg组织,加入1ml TRIzol试剂,用玻璃 -Teflcm 或电动匀浆器勾浆。样本体积不能超过 TRIzol 试剂的10%
2 ) 单层培养细胞:在 3. 5cm 的培养皿中加入 1ml TRIzol 试剂•用吸管抽吸细胞多次,直接裂解细胞。加入 TRIzol试剂的量取决于培养皿的大小(1ml / 10cm2)而不取决于细胞的量。TRIZol 试剂的量若不足,分离的 RNA 易受 DNA 污染。
3 ) 悬浮细胞:离心收集细胞,加 入 TRIzol 试剂屮反复吹打裂解细胞。动物,植物,酵母每 5X106~10×106 个细胞用 lml TRIzol 试剂。加 TRIzol 试剂前请勿洗涤细胞,因为这样会增加 RNA 的降解。可用勻浆器裂解细荫和酵母细胞。
2 . 相的分离
1 ) 匀浆后于 15 〜30 ℃放置 5min,以保证核蛋白复合体完全分离。
2 ) 加入 0.2m l 氯仿 /lm l TRIzol试剂。盖好样本管于 15 〜30℃ 用手剧烈摇动 15s ,放置 2〜3min。于 2〜8° C 小于 12000 g 离心 10mm。离心后、混合物分为三相:即最下层红色的酚-氯仿相,中间相以及上层水相& RNA绝大多数留于水相,水相体积用于匀浆的 TRlzol 试剂体积的 60%。
3. R N A 沉淀
1 ) 将水相移至一新管(若要分离DNA或蛋白质,保留有机相),加人异丙醇,混合均匀,以沉淀 RNA。每1ml TRizol试剂加入0. 5ml 异丙醇,于 15〜30℃ 放置 10min
2)于2 〜8℃小于12000 g 离心 10min. 离心前,常看不到 RNA 沉淀,离心后 RNA 形成胶状颗粒物.沉枳在管的底部和壁上。
4. R N A 洗涤
1 ) 移去上清液,用 75% 乙醇洗涤 RNA 沉淀一次,每 1mlTRIzol 试剂至少加入加入1ml7 5 % 乙醇混匀,于 2〜8℃ 7500g 离心5min。
2 )弃上清
5.RNA溶解
1) RNA沉淀空气干燥 5〜l 0 min。勿在真空状态下离心干燥RNA,并注意勿使 RNA 完全干燥,因为这会大大降低其溶解性。若RNA 未完全溶解,其 A260/280 <1.6
2 ) 加入不含 RNase 的水或 0.5% SDS 溶液,反复吹打以溶解RNAg 如RNA较难溶解,可于 55〜60℃ 助溶 10min
1)氯仿
2)异丙醇
3)75%乙醇(用DEPC水配制)
4)无RNase的水(将水加入无 RNase 的玻璃瓶内,加浓度为0.1 % ( V /V)的DEPC过夜 ,尚压灭菌)
5)0.5%SDS溶液(必须DEPC处理过的高压灭菌水配制 )
6)TRIzol 试剂
二 操作方法
1 . 匀浆
1 ) 组织:每 50〜l0 mg组织,加入1ml TRIzol试剂,用玻璃 -Teflcm 或电动匀浆器勾浆。样本体积不能超过 TRIzol 试剂的10%
2 ) 单层培养细胞:在 3. 5cm 的培养皿中加入 1ml TRIzol 试剂•用吸管抽吸细胞多次,直接裂解细胞。加入 TRIzol试剂的量取决于培养皿的大小(1ml / 10cm2)而不取决于细胞的量。TRIZol 试剂的量若不足,分离的 RNA 易受 DNA 污染。
3 ) 悬浮细胞:离心收集细胞,加 入 TRIzol 试剂屮反复吹打裂解细胞。动物,植物,酵母每 5X106~10×106 个细胞用 lml TRIzol 试剂。加 TRIzol 试剂前请勿洗涤细胞,因为这样会增加 RNA 的降解。可用勻浆器裂解细荫和酵母细胞。
2 . 相的分离
1 ) 匀浆后于 15 〜30 ℃放置 5min,以保证核蛋白复合体完全分离。
2 ) 加入 0.2m l 氯仿 /lm l TRIzol试剂。盖好样本管于 15 〜30℃ 用手剧烈摇动 15s ,放置 2〜3min。于 2〜8° C 小于 12000 g 离心 10mm。离心后、混合物分为三相:即最下层红色的酚-氯仿相,中间相以及上层水相& RNA绝大多数留于水相,水相体积用于匀浆的 TRlzol 试剂体积的 60%。
3. R N A 沉淀
1 ) 将水相移至一新管(若要分离DNA或蛋白质,保留有机相),加人异丙醇,混合均匀,以沉淀 RNA。每1ml TRizol试剂加入0. 5ml 异丙醇,于 15〜30℃ 放置 10min
2)于2 〜8℃小于12000 g 离心 10min. 离心前,常看不到 RNA 沉淀,离心后 RNA 形成胶状颗粒物.沉枳在管的底部和壁上。
4. R N A 洗涤
1 ) 移去上清液,用 75% 乙醇洗涤 RNA 沉淀一次,每 1mlTRIzol 试剂至少加入加入1ml7 5 % 乙醇混匀,于 2〜8℃ 7500g 离心5min。
2 )弃上清
5.RNA溶解
1) RNA沉淀空气干燥 5〜l 0 min。勿在真空状态下离心干燥RNA,并注意勿使 RNA 完全干燥,因为这会大大降低其溶解性。若RNA 未完全溶解,其 A260/280 <1.6
2 ) 加入不含 RNase 的水或 0.5% SDS 溶液,反复吹打以溶解RNAg 如RNA较难溶解,可于 55〜60℃ 助溶 10min
注意事项
1)RNA 产量低:其原因可能有以下几点:样本未完全匀浆或裂解;RMA 沉淀未完全溶解。
2)A260/280<1.65 其原因可能有以下几点:样本太少;匀浆后,标本未室温放置水相受酚污染;RNA 沉淀未完全溶解。
3)RNA 降解:其原因可能有以下几点:从动物中取出的组织未立即加工或冻存;分离 RNA 的样本储存于-5〜一 20°C, 而不是一 60〜一 70℃:; 细胞被胰酶消化;溶液或管中含有 RNase; 用于琼脂糖凝胶电泳的甲醛 PH<3.L
4)DNA 污染:其原因可能有以下几点:样本太少;用于分离的样本含有机溶剂如乙醇、DMSO) 虽缓冲液或碱性溶液。
5) 蛋白多糖和多糖的污染:下列改进的 RNA 沉淀法(步骤 3), 可从分离的 RNA 中去除这些污染物。水相中每毫升 TRIzolml 加入 0.25 ml 异丙醇,再加 0.25 ml 卨盐沉淀液 (0.8mol/L 柠檬酸钠 1.2mol/LNaCl), 混合,离心,如前所述。这样可有效沉淀 RNA 而蛋白多糖和多糖则留在液相。
6) 从少量样本 (细胞≤104 或组织≤10 mg) 中提取 RMA 时,加入 0.8 mlTRIzol 试剂,匀浆后,加入氯仿,进行 RNA 的分离,如步骤 2。用异丙醇沉淀 RNA 前,加入 5〜10 微克无 RNase 的糖原。
7) 若样本中含有高浓度的蛋白质 J 旨肪. 多糖或细胞外物质,肌肉、脂肪组织、植物茎块,则需进行额外的分离。匀浆后,2〜12000 g 离心 10 mm, 将不溶性物质去除所得的沉淀包含有细胞外膜、多糖和髙分子质量的 DNA,上清液则含有 RNA。来自脂肪组织的样本,脂肪聚集在上层,可去除. 将处理好的匀浆液移至新管,如上所述,加氯仿进行液相分离.
8)匀浆后加氯仿前样本可于-60〜- 70℃ 储存至少一个月。RNA 沉淀可在 75% 乙醇中 2〜8℃ 放置至少一个星期,- 5〜-20 ℃至少放置一年。
9) 若在步骤 2)、3) 中,离心转速为 2600 g, 时间需增加到 20〜30 min。
10)TRIzol 试剂有毒,若与皮肤接触后,用清洗剂充分水洗。若感觉不适,应速去医院。TRIzol 试剂储存于 2〜8℃ 若室温储存,有效期为 12 个月。
2)A260/280<1.65 其原因可能有以下几点:样本太少;匀浆后,标本未室温放置水相受酚污染;RNA 沉淀未完全溶解。
3)RNA 降解:其原因可能有以下几点:从动物中取出的组织未立即加工或冻存;分离 RNA 的样本储存于-5〜一 20°C, 而不是一 60〜一 70℃:; 细胞被胰酶消化;溶液或管中含有 RNase; 用于琼脂糖凝胶电泳的甲醛 PH<3.L
4)DNA 污染:其原因可能有以下几点:样本太少;用于分离的样本含有机溶剂如乙醇、DMSO) 虽缓冲液或碱性溶液。
5) 蛋白多糖和多糖的污染:下列改进的 RNA 沉淀法(步骤 3), 可从分离的 RNA 中去除这些污染物。水相中每毫升 TRIzolml 加入 0.25 ml 异丙醇,再加 0.25 ml 卨盐沉淀液 (0.8mol/L 柠檬酸钠 1.2mol/LNaCl), 混合,离心,如前所述。这样可有效沉淀 RNA 而蛋白多糖和多糖则留在液相。
6) 从少量样本 (细胞≤104 或组织≤10 mg) 中提取 RMA 时,加入 0.8 mlTRIzol 试剂,匀浆后,加入氯仿,进行 RNA 的分离,如步骤 2。用异丙醇沉淀 RNA 前,加入 5〜10 微克无 RNase 的糖原。
7) 若样本中含有高浓度的蛋白质 J 旨肪. 多糖或细胞外物质,肌肉、脂肪组织、植物茎块,则需进行额外的分离。匀浆后,2〜12000 g 离心 10 mm, 将不溶性物质去除所得的沉淀包含有细胞外膜、多糖和髙分子质量的 DNA,上清液则含有 RNA。来自脂肪组织的样本,脂肪聚集在上层,可去除. 将处理好的匀浆液移至新管,如上所述,加氯仿进行液相分离.
8)匀浆后加氯仿前样本可于-60〜- 70℃ 储存至少一个月。RNA 沉淀可在 75% 乙醇中 2〜8℃ 放置至少一个星期,- 5〜-20 ℃至少放置一年。
9) 若在步骤 2)、3) 中,离心转速为 2600 g, 时间需增加到 20〜30 min。
10)TRIzol 试剂有毒,若与皮肤接触后,用清洗剂充分水洗。若感觉不适,应速去医院。TRIzol 试剂储存于 2〜8℃ 若室温储存,有效期为 12 个月。
来源:丁香实验