丁香实验_LOGO
登录
提问
我要登录
|免费注册

不同条件pcr,条带相同

相关实验:双重 PCR 实验

user-title

dxy_kazga6uq

前后做了两次pcr,用的cDNA模板

基因大小在3/4kb,但是每次扩出来都只有1/2kb,这是什么原因呢?更改条件扩出来的条带也没有变化,不知道该怎么修改条件了

因为引物Tm值只有四十多,所以退火温度选择也低

①94℃1min,后98℃10s+45℃15s+72℃1min,再72℃10min

②94℃1min,后98℃10s+42℃30s+72℃2min,再72℃10min

wx-share
分享

2 个回答

user-title

沫子大大

有帮助

基因扩增大小小于期望大小的原因可能有很多种,包括引物设计问题、扩增条件不恰当、DNA模板质量问题等。针对你提供的PCR条件,建议尝试以下优化:尝试增加退火温度,比如从45℃调整到50℃或更高的温度,看看是否能够增加扩增产物大小。
延长延伸时间,比如从1分钟延长到2分钟。确保使用高质量的DNA模板,并检查模板DNA的浓度是否适当。如果以上优化步骤无法解决问题,建议尝试更换引物,并重新进行优化。

user-title

sswei

有帮助

可能要考虑以下这几种情况:

1、低质量的cDNA:cDNA合成过程中可能存在RNA降解、反转录不完全或反转录过程中引入的污染物等问题,导致cDNA质量不佳,从而影响PCR扩增效果。

2、PCR反应条件不当:PCR反应条件包括温度、反应时间、引物浓度、酶浓度、缓冲液等,如果这些条件设置不当,可能会影响PCR扩增效果。

3、引物设计问题:引物的设计可能存在问题,比如引物长度不合适、引物序列中存在不稳定结构、引物与模板匹配度不佳等,都可能导致PCR扩增失败。


提问
扫一扫
丁香实验小程序二维码
实验小助手
丁香实验公众号二维码
关注公众号
反馈
TOP
打开小程序