借鉴了别人的引物，怎么判断没有二聚体

输入序列，用oligoanalyzer分析一下，会给出二聚体的值

可以用OligoCalc判断：OligoCalc是一个在线工具，可以预测引物的二聚体形成自由能（delta G）。如果delta G值低于-9 kcal/mol，则说明引物有很强的二聚体倾向。

oligocalc和oligoanalyzer或者pcr stimulator等

在PCR实验中，二聚体的形成确实可能导致引物间的非特异性扩增，从而导致条带弥散的问题。以下是一些方法可以帮助你判断引物之间是否存在二聚体合：

1. OligoAnalyzer工具：OligoAnalyzer是一种在线工具，可以评估引物序列之间的二聚体形成潜力。你可以将每对引物的序列输入该工具中，它将计算引物之间的二聚体结合能，并给出一个预测评分。较高的评分表明引物之间更可能形成二聚体。

2. 热独立性实验：热独立性实验是一种实验方法，用于评估引物之间的相互作用。该实验基于引物之间的热稳定性差异。你可以在一系列温度下进行PCR反应，包括较低的温度（如50°C），以观察是否出现非特异性扩增。如果引物之间存在二聚体，你可能会观察到非特异性扩增产物的形成。

3. 引物设计优化：如果你怀疑引物之间的二聚体合，你可以重新设计引物以减少二聚体形成的可能性。确保引物之间的碱基序列不具有互补性，并且引物的长度和熔解温度相似。

4. 引物设计软件：有一些引物设计软件可以帮助你选择合适的引物，以最大程度地减少二聚体形成。例如，Primer3、OligoPerfect和Beacon Designer等软件通常具有评估二聚体形成的功能。

看他们的碱基序列匹配度啊，多多少少都会有二聚体的

双链体形成:这是评估引物二聚体的形成，包括自形成二聚体和引物对引物二聚体，主要是看引物3’端是否有配对碱基(最好没有)。目前oligo是在编辑引物时对原始引物的分析(如添加限制性位点)。形成的二聚体取决于能量值g(所以不会输入！)，能量值越低越好，最好不要超过4.5。