秋秋欣欣
先查找自己所需要的DNA或者RNA的序列,打开软件点primer根据自己的要求设定碱基长度即可。
bamboopiggy
你直接从这里看https://wenku.baidu.com/view/7dbe4b010740be1e650e9ac7.html?re=view
balalaLy
要不试试oligo这个软件吧,傻瓜式的操作,超简单
未来9
1、查找基因cDNA/mRNA序列(物种名+基因名):实验室已有的某物种基因组数据库中查找或NCBI上查找。
2、获得基因序列后,打开primer 5.0 点击File-new-DNA sequence 粘贴cDNA序列-as is-ok,点primer,点search-调整如图参数(产物长度一般为100-300,引物长度一般为20左右,视情况调整);根据系统设计的引物进行筛选,优先评分较高的。
需要注意:S是上游引物,A是下游引物,sense,anti-sense最好都是None,再细看
汤姆卜丽波
首先下载安装并激活Primer Premier 5 软件,打开软件,点击左上角,选择“File”→ “New” →“DNA Sequence”,然后复制参考模板DNA序列,在输入框内点击Ctrl+V键,将DNA序列粘贴进来:接着点击左上角“Primer”按钮,再点击“Search” 按钮,然后选择并输入一些参数,一般最上面点击“PCR Primer”,下面选择“Pairs”,然后输入上游(正义,Sense)链引物及下游(反义,Anti-sense)链引物的设计位置范围,这个需要你预先知道你要扩增的片段在哪里,大概估算一下,比如我想扩增参考模板序列的200-2100中间这1900bp长度的片段,我的上游引物就在1-200之间,下游引物就在1900-最尾部之间;接着再输入一下PCR产物大小范围,很简单,比如我想要200-2100中间的1900bp ,那么最小的PCR产物大小应该是1900bp,当然,一般软件设计都会大于这个长度的,所以最大的长度可以不受限,但越长往往越难扩,所以适度就好,这里我就输入参考模板的最大长度;然后再选择一下设计的引物长短区间,一般23±3bp或5bp,引物长度越长,一般退火温度也会越高,搜索模式的话一般是选择自动“Automatic”,这时,软件自动将已经设计好的引物展示在右上角的窗口,默认按引物对的分数从高到低进行排列,选中某一对引物后,左下角会出现该引物对的一些参数,可以让我们评判好坏,比如发夹结构、二聚体、有没有错配及引物的长度、起始位置、GC含量等,你可以根据自己的要求选择适合自己的引物,如果是小白的话,建议从分数最高的引物对开始测试PCR扩增效果。
最后,导出我们想到的引物对信息,点击“File”→ “Print” →“Current Pair”,选择“Primer Pair”进行打印,一般用虚拟PDF打印机如Adobe、福昕、Doro之类的,确定后选择保存位置、名字就可以了,后面我们可以打开输出的PDF软件浏览引物对的信息,并复制这些信息将其送到相应的生物公司进行引物对的合成。
灵枢天问
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